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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2017 | Identificação de variação no número de cópias em bovinos leiteiros usando dados de NGS. | CHUD, T. C. S.  ; ZERLOTINI NETO, A.; CARMO, A. S. do; MUNARI, D. P.; SILVA, M. V. G. B. |
| 2018 | Identification of putative regulatory regions and transcription factors associated with intramuscular fat content traits. | CESAR, A. S. M.; REGITANO, L. C. de A.; REECY, J. M.; POLETI, M. D.; OLIVEIRA, P. S. N.; OLIVEIRA, G. B. de; MOREIRA, G. C. M.; MUDADU, M. de A.; TIZIOTO, P. L.; KOLTES, J. E.; Fritz-Waters, E.; KRAMER, L.; GARRICK, D.; BEIKI, H.; GEISTLINGER, L.; MOURÃO, G. B.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L. |
| 2017 | LDHB gene has allele-specific expression in liver of Nelore cattle extremes for feed efficiency. | ROCHA, M. I. P.; SOUZA, M. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N. de; LIMA, A. O. de; AFONSO, J.; DINIZ, W. J. da S.; BUSS, C. E.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; NICIURA, S. C. M. |
| 2019 | Machado: a genomic data integration framework for Chado developed with Django. | MUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. |
| 2020 | Machado: open source genomics data integration framework. | MUDADU, M. de A.; ZERLOTINI NETO, A. |
| 2014 | Monoallelic expression of NNAT gene in Nelore steers skeletal muscle. | SOUZA, M. M.; ZERLOTINI NETO, A.; TIZIOTO, P. C.; OLIVEIRA, P. S. N.; SOMAVILLA, A. L.; MOKRY, F. B.; CESAR, A. S. M.; DINIZ, W. J. S.; MUDADU, M. de A.; NICIURA, S. C. M.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A. |
| 2013 | Next generation sequencing and de novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome. | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. |
| 2019 | Novel polymorphisms in the PLIN2 gene of Nellore cattle. | DEFANT, H.; MEIRA, A. N.; COUTINHO, L. L.; REGITANO, L. C. de A.; POLETI, M. D.; MOREIRA, G. C. M.; PADUAN, M.; MARIANI, P.; ZERLOTINI NETO, A.; MOURÃO, G. B.; CESAR, A. S. M. |
| 2015 | Perfil de expressão de genes em trigo em resposta à infecção por ferrugem da folha. | CASASSOLA, A.; BRAMMER, S. P.; CHAVES, M. S.; NHANI JUNIOR, A.; FALCAO, P. R. K.; ZERLOTINI NETO, A.; STEFANATO, F; BOYD, L. |
| 2021 | Plant Co-expression Annotation Resource: a web server for identifying targets for genetically modified crop breeding pipelines. | VIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. |
| 2019 | Plant Co-expression Annotation Tool: a tool to identify targets for proof of concept in Genetically Modified crop breeding pipelines. | VIANA, M. J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; MUDADU, M. de A. |
| 2020 | Potential biomarkers for feed efficiency-related traits in nelore cattle identified by co-expression network and integrative genomics analyses. | LIMA, A. O. de; KOLTES, J. E.; DINIZ, W. J. S.; OLIVEIRA, P. S. N. de; CESAR, A. S. M.; TIZIOTO, P. L.; AFONSO, J.; SOUZA, M. de S.; PETRINI, J.; ROCHA, M. I. P.; CARDOSO, T. F.; ZERLOTINI NETO, A.; COUTINHO, L. L.; MOURÃO, G. B.; REGITANO, L. C. de A. |
| 2015 | Reconstructing the whole mitochondrial DNA (mtDNA) from nuclear genome. | CASTRO, G. M. de; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2017 | Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds. | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. |
| 2017 | Single nucleotide variants and InDels identified from whole-genome re-sequencing of Guzerat, Gyr, Girolando and Holstein cattle breeds. | STAFUZZA, N. B.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; COLE, J. B.; SILVA, M. V. G. B. |
| 2012 | Using Galaxy to facilitate RNA-Seq analysis. | NAGAI, L. A. E.; SILVA, F. R.; CINTRA, L. C.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. |
| 2012 | Utilização da plataforma Galaxy na análise de dados de RNAseq. | NAGAI, L. A. E.; GIACHETTO, P. F.; ZERLOTINI NETO, A. |
