Caracterização biológica e molecular de isolados de Apple stem grooving virus e construção de um clone infeccioso.

SOUZA, E. B. de

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Campo DC	Valor	Idioma
dc.contributor.author	SOUZA, E. B. de	pt_BR
dc.date.accessioned	2017-01-12T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.available	2017-01-12T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.created	2017-01-12	pt_BR
dc.date.issued	2016	pt_BR
dc.identifier.citation	2016.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1060658	pt_BR
dc.description	O Apple stem grooving virus (ASGV), espécie tipo do gênero Capillovirus, é conhecido como um vírus latente causador do acanelamento do lenho da macieira, devido ao principal sintoma observado em espécies suscetíveis, infecção podendo levar à perda de qualidade de frutos e queda na produtividade. O vírus já foi diagnosticado em diversas partes do mundo e atualmente, existem depositados no GenBank, dezoito sequências de genomas completos de isolados de ASGV, e várias sequências parciais principalmente da região da capa proteica. O presente trabalho está dividido em dois capítulos. O capítulo l teve como objetivo a caracterização biológica e molecular de dois isolados de ASGV (M219-3 e M220), e de forma mais específica, a clonagem e sequenciamento do genoma completo dos mesmos e a análise filogenética em comparação com demais sequências disponíveis. Os fragmentos foram amplificados por RT-PCR, clonados, sequenciados e analisados com os programas Clustal W e Lasergene. O capítulo ll teve como objetivo a construção de um clone infeccioso, a partir do isolado M220, utilizando-se a técnica Gibson Assembly. Ambos isolados apresentaram-se de forma similar quanto a expressão de sintomas morfológicos. Os resultados obtidos permitiram a obtenção das primeiras sequências genômicas completas de isolados brasileiros de ASGV, bem como a construção de um clone infeccioso. A identidade entre M219-3 e M220 foi de 92.2%, quando comparada a sequência de nucleotídeos, e 95.3% e 93.3%, quando comparadas as sequencias de aminoácidos da proteína de movimento e capsídeo, respectivamente. A análise filogenética da proteína de movimento dos isolados com as sequências depositadas determinou dois grupos distintos quanto ao hospedeiro. M219-3 e M220 agruparam-se juntamente com isolados cujo os hospedeiros eram predominantemente maça e pera. Dada a relevância da infecção causada por esse vírus, o trabalho contribuirá para estudos da variabilidade genética dessa espécie viral, bem como para a elucidação da associação do ASGV com a patologia já relatada na literatura.	pt_BR
dc.language.iso	por	pt_BR
dc.rights	openAccess	pt_BR
dc.subject	ASGV-sequenciamento	pt_BR
dc.subject	Capillovirus Betaflexiviridae	pt_BR
dc.subject	Gibson Assembly	pt_BR
dc.subject	CDNA	pt_BR
dc.title	Caracterização biológica e molecular de isolados de Apple stem grooving virus e construção de um clone infeccioso.	pt_BR
dc.type	Teses	pt_BR
dc.date.updated	2017-11-27T11:11:11Z	pt_BR
dc.subject.thesagro	Malus Domestica	pt_BR
dc.description.notes	Tese (Doutorado em Fitossanidade) - Universidade Federal de Pelotas, Programa de pós-graduação em Fitossanidade. Orientador: Profª. Dra. Danielle Ribeiro de Barros Coorientadores: Dr. Osmar Nickel e Dr. Cesar Bauer Gomes	pt_BR
riaa.ainfo.id	1060658	pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate	2017-11-27 -02:00:00	pt_BR
dc.contributor.institution	Elen Bonilha de Souza.	pt_BR
Aparece nas coleções:	Tese/dissertação (CNPUV)

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TESESouzaElenBonilhaVersaoDefesal11.08.2016.pdf		1,43 MB	Adobe PDF	Visualizar/Abrir

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