Development of a molecular method for detection and identification of Xanthomonas campestris pv. viticola.

TRINDADE, L. C. da; MARQUES, E.; LOPES, D. B.; FERREIRA, M. A. da S. V.

Use este identificador para citar ou linkar para este item: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/157785

Registro completo de metadados

Campo DC	Valor	Idioma
dc.contributor.author	TRINDADE, L. C. da	pt_BR
dc.contributor.author	MARQUES, E.	pt_BR
dc.contributor.author	LOPES, D. B.	pt_BR
dc.contributor.author	FERREIRA, M. A. da S. V.	pt_BR
dc.date.accessioned	2011-04-09T20:28:27Z	-
dc.date.available	2011-04-09T20:28:27Z	-
dc.date.created	2007-04-19	pt_BR
dc.date.issued	2007	pt_BR
dc.identifier.citation	Summa Phytopathologica, Botucatu, v. 33, n. 1, p. 16-23, mar. 2007.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/157785	pt_BR
dc.description	Com o objetivo de desenvolver um método molecular para detecção e identificação de Xanthomonas campestris pv. viticola (Xcv), agente causal do cancro bacteriano da videira, oligonucleotídeos (primers) foram desenhados com base na seqUência parcial do gene hrpB. As combinações de primers XcvlF/Xcv3R e RST2/Xcv3R que amplificaram fragmentos de 243 e 340 pb, respectivamente, foram testadas quanto à especificidade e sensibilidade para detecção do DNA de Xcv. Com os dois pares de primers, amplificação foi positiva com o DNA de 44 isolados de Xcv, mas também com quatro isolados de X.c. pv. mangiferaeindicae e cinco de X. axonopodis pv. passiflorae. Contudo, a digestão dos produtos de PCR permitiu diferenciar Xcv dos isolados desses patovares. Nenhum dos dois pares de primers amplificou o DNA de videira, nem de 20 bactérias não patogênicas isoladas da flora da videira, ou de 10 isolados de outros seis gêneros de bactérias fitopatogênicas. A sensibilidade dos primers XcvlF/Xcv3R e RST2IXcv3R foi de 10 pg e 1 pg de DNA purificado de Xcv, respectivamente. O limite de detecção de RST2/Xcv3R foi de 10. UFC/ml, mas empregando-se uma segunda rodada de amplificação com o primer interno XcvlF, esse limite foi de 102 UFC/ml. Não foi possível detectar por PCR a presença de Xcv usando-se diretamente na reação, O extrato do macerado de pecíolos de videira previamente inoculados. Entretanto, amplificações foram positivas quando se utilizou uma etapa de enriquecimento em meio de cultura antes da PCR. Detectou-se Xcv em 1 ~I da suspensão obtida do lavado das placas e em uma suspensão obtida a partir de uma única colônia. A identidade da bactéria foi confirmada pela análise de RFLP dos produtos de amplificação dos primers RST2/Xcv3R com HaeIII.	pt_BR
dc.language.iso	eng	eng
dc.rights	openAccess	eng
dc.subject	Videira	pt_BR
dc.subject	Cancro bacteriaro	pt_BR
dc.subject	PCR	pt_BR
dc.subject	Xanthomonas campestris pv	pt_BR
dc.subject	viticola	pt_BR
dc.title	Development of a molecular method for detection and identification of Xanthomonas campestris pv. viticola.	pt_BR
dc.type	Artigo de periódico	pt_BR
dc.date.updated	2019-08-02T11:11:11Z	pt_BR
dc.subject.thesagro	Doença	pt_BR
dc.subject.thesagro	Uva	pt_BR
riaa.ainfo.id	157785	pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate	2019-08-02 -03:00:00	pt_BR
dc.contributor.institution	DANIELA BIAGGIONI LOPES, CPATSA.	eng
Aparece nas coleções:	Artigo em periódico indexado (CPATSA)

Arquivos associados a este item:

Arquivo	Descrição	Tamanho	Formato
OPB1011.pdf		42,69 MB	Adobe PDF	Visualizar/Abrir

Mostrar registro simples do item Visualizar estatísticas