Obtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico.

ANDRADE, F. T.; CAIXETA, E. T.; MACIEL, B. H.; ALVARENGA, S. M.; ZAMBOLIM, E. M.; SAKIYAMA, N. S.

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Registro completo de metadados

Campo DC	Valor	Idioma
dc.contributor.author	ANDRADE, F. T.	pt_BR
dc.contributor.author	CAIXETA, E. T.	pt_BR
dc.contributor.author	MACIEL, B. H.	pt_BR
dc.contributor.author	ALVARENGA, S. M.	pt_BR
dc.contributor.author	ZAMBOLIM, E. M.	pt_BR
dc.contributor.author	SAKIYAMA, N. S.	pt_BR
dc.date.accessioned	2011-11-18T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.accessioned	2011-11-18T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.available	2011-11-18T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.available	2011-11-18T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.created	2011-11-18	pt_BR
dc.date.issued	2007	pt_BR
dc.identifier.citation	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906362	pt_BR
dc.description	A partir das informações geradas no Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) foram identificadas, por meio de análise in silico, seqüências potencialmente envolvidas na resistência a Hemileia vastatrix Berk. et Br. presentes nos cafeeiros. Foram usadas diferentes estratégias para minerar as seqüências de interesse. Inicialmente, palavras-chave que correspondem a termos relacionados aos mecanismos de resistência de plantas a patógenos foram obtidas da literatura e utilizadas como ?iscas? para mineração dos dados. Com o auxílio de ferramentas disponíveis na plataforma de bioinformática do PBGC, criaram-se projetos englobando as ESTs (Expressed Sequence Tags) relacionadas a cada uma destas palavras. Outra estratégia utilizada foi a busca por similaridades entre algumas seqüências envolvidas com a resistência do cafeeiro a doenças já publicadas com as seqüências do PBGC, por meio do algoritmo BLAST. Utilizou-se, também, o ?Electronic Northern?, uma ferramenta desenvolvida pelo Laboratório de Genômica e Expressão (LGE). A mineração, usando as três estratégias, identificou 8.968 seqüências do PBGC. O envolvimento ou ligação destas seqüências com genes de resistência à ferrugem do cafeeiro será confirmado, em trabalhos futuros, utilizando marcadores moleculares e técnicas de genômica funcional.	pt_BR
dc.language.iso	por	pt_BR
dc.rights	openAccess	pt_BR
dc.subject	Mineração de dados	pt_BR
dc.subject	Bioinformática	pt_BR
dc.subject	Genômica	pt_BR
dc.title	Obtenção de ESTs potencialmente relacionadas à resistência do cafeeiro à ferrugem por meio de análise in silico.	pt_BR
dc.type	Artigo em anais e proceedings	pt_BR
dc.date.updated	2011-11-18T11:11:11Z	pt_BR
dc.subject.thesagro	Café	pt_BR
riaa.ainfo.id	906362	pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate	2011-11-18	pt_BR
dc.contributor.institution	FLÁVIA THIEBAUT ANDRADE, UFV/BIOAGRO; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; BÁRBARA HUFNAGEL MACIEL, UFV/BIOAGRO; SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV/BIOAGRO; EUNIZE MACIEL ZAMBOLIM, UFV; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV.	pt_BR
Aparece nas coleções:	Artigo em anais de congresso (SAPC)

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