Title:	Variabilidade no domínio LRR de peptídeos codificados em "clusters" homólogos ao SH3 em diferentes genomas de Coffea.
Authors:	ANGELO, P. C. da S. ARIYOSHI, C. CAIXETA, E. T. PEREIRA, L. F. P. RIBAS, A. F. SERA, G. H.
Affiliation:	PAULA CRISTINA DA SILVA ANGELO, CNPCa; Caroline Ariyoshi, Universidade Estadual de Londrina/IAPAR; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA MOURA, CNPCa; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, CNPCa; Alessandra F. Ribas, Universidade do Oeste Paulista; Gustavo H. Sera, IAPAR.
Date Issued:	2019
Citation:	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.
Description:	O locus SH3 é relacionado com as reações de defesa contra Hemileia vastatrix, o agente causador da ferrugem alaranjada. Há um ?cluster? de genes CC-NBS-LRR no locus SH3 da variedade IAPAR59 de Coffea arabica. Esse ?cluster? reúne oito cópias de CC-NBS-LRRs, que variam na sua estrutura primária, especialmente na região carboxi-terminal onde são localizados motivos ricos em leucina. Esses motivos LRR são característicos de proteínas que participam do reconhecimento de patógenos pelas plantas. Os ?clusters? homólogos na variedade Caturra e em um cafeeiro de origem etíope da espécie C. arabica, em C. canephora DH200-94 e em C. eugenioides CCC68 foram identificados. A variabilidade das regiões codificadoras incluídas no ?cluster? SH3 foi avaliada alinhando com o aplicativo CLUSTAW e agrupando pelo método de Fitsh-Margoliash as sequências da região carboxi-terminal dos peptídeos deduzidos de todas as cópias de NBS-LRRs codificadas em ?clusters? homólogos naqueles quatro genótipos e também previamente analisadas em IAPAR59 e em C. canephora IF200. Concluiu-se que há divergência entre as sequências dos domínios LRR de diferentes membros dos ?clusters? em diferentes genótipos, o que pode ser parcialmente resultante dos processos de sequenciamento e montagem, mas que também resulta de evolução e seleção. Também há diferença no número de cópias do gene em diferentes genótipos. Consideramos a hipótese de que o número, a organização, a integridade e a estrutura primária dos genes nos ?clusters? SH3 podem estar relacionados com o mecanismo de reconhecimento das raças fisiológicas de H. vastatrix por diferentes variedades de cafeeiros.
NAL Thesaurus:	Protein isoforms
Keywords:	Doença do cafeeiro Polimorfismo estrutural Isoformaprotéica Coffee disease Structural polymorphism
Notes:	Título em inglês: LRR domain variability for peptides encoded in gene clusters homologous to the SH3 in different Coffea genomes.
Type of Material:	Artigo em anais e proceedings
Access:	openAccess
Appears in Collections:	Artigo em anais de congresso (SAPC)