Title:	ESTs de Coffea arabica do tipo genes R classe 3 identificadas no CafEST.
Authors:	CAMPOS, M. A. SILVA, F. B. SILVA, M. S. FREIRE, E. V. S. A. TEIXEIRA, C. de C. REIS, A. M. dos SA, M. F. G. de
Affiliation:	MAGNÓLIA A. CAMPOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; FLÁVIA B. SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE LAVRAS; MARILIA SANTOS SILVA PATRIOTA, CPAC; ERIKA VALERIA SALIBA ALBUQUERQUE FR, CENARGEN; CRISTIANE DE CAMARGO TEIXEIRA, UNIVERSIDADE DE BRASÍLIA; ANGELA MEHTA DOS REIS, CENARGEN; MARIA FATIMA GROSSI DE SA, CENARGEN.
Date Issued:	2007
Citation:	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. 1 CD-ROM.
Pages:	4 p.
Description:	Café é uma importante commodity e um dos produtos agrícolas mais comercializados e consumidos no mundo. Por isso, o sequenciamento em larga escala de sequências expressas (ESTs) em órgãos de espécies de cafeeiro foi realizado e resultou na formação do banco de dados brasileiro do genoma funcional de café (CafEST). Apesar da produção e consumo de Coffea arabica corresponder à cerca de 70% do mercado de café, essa espécie é altamente susceptível a nematóides, pragas e patógenos. Portanto, há um crescente interesse de programas de melhoramento genético de cafeeiro em desenvolver variedades de C. arabica com resistência a esses agentes fitopatológicos. Inúmeros genes de resistência (genes R) já foram isolados de várias plantas e foram agrupados em classes de 1 a 6. Com o objetivo de elucidar se subclasses das 6 classes de genes R estão representadas nos genomas de espécies de café, uma estratégia de identificação de genes baseada em mineração de dados genômicos está sendo empregada para selecionar ESTs do banco CafEST que representem cada classe e subclasse já descrita. O presente trabalho relata a presença de um total de 293 ESTs relacionadas com genes R classe 3 (genes do tipo LRR/NBS/TIR) no genoma de C. arabica, as quais foram identificadas dentro do banco CafEST por homologia no BLAST. Dentre essas sequências, 101 representam a subclasse RPP4 e foram agrupadas em 56 clusters. Adicionalmente, 93 ESTs representando a subclasse RPP5 foram encontradas e agrupadas em 46 clusters. Finalmente, as últimas 99 ESTs encontrados representam a subclasse RPS4 e foram agrupadas em 54 clusters. No entanto, nenhuma EST foi encontrada representando as outras subclasses de genes R classe 3 (L, M, N, P e RPP1) no banco CafEST com base nos critérios empregados. A estratégia usada para selecionar ESTs de C. arabica que potencialmente codificam genes R classe 3 dentro do CafEST permitiu a identificação de vários prováveis genes.
Thesagro:	Café Gene Resistência Genética
Type of Material:	Artigo em anais e proceedings
Access:	openAccess
Appears in Collections:	Artigo em anais de congresso (CPAC)