Title:	Genome of Herbaspirillum seropedicae Strain SmR1, a specialized diazotrophic endophyte of tropical grasses.
Authors:	PEDROSA, F. O. MONTEIRO, R. A. WASSEM, R. CRUZ, L. M. AYUB, R. A. COLAUTO, N. B. FERNANDEZ, M. A. FUNGARO, M. H. P. GRISARD, E. C. HUNGRIA, M. MADEIRA, H. M. F. NODARI, R. O. OSAKU, C. A. PETZL-ERLER, M. L. TERENZI, H. VIEIRA, L. G. E. STEFFENS, M. B. R. WEISS, V. A. PEREIRA, L. F. P. ALMEIDA, M. I. M. ALVES, L. R. MARIN, A. ARAUJO, L. M. BALSANELLI, E. BAURA, V. A. CHUBATSU, L. S. FAORO, H. FAVETTI, A. FRIEDERMANN, G. GLIENKE, C. KARP, S. KAVA-CORDEIRO, V. RAITTZ, R. T. RAMOS, H. J. O. RIBEIRO, E. M. S. F. RIGO, L. U. ROCHA, S. N. SCHWAB, S. SILVA, A. G. SOUZA, E. M. MICHELLE Z. TADRA-SFEIR TORRES, R. A. DABUL, A. N. G. SOARES, M. A. M. GASQUES, L. S. GIMENES, C. C. T. VALLE, J. S. CIFERRI, R. R. CORREA, L. C. MURACE, N. K. PAMPHILE, J. A. PATUSSI, E. V. PRIOLI, A. J. PRIOLI, S. M. A. ROCHA, C. L. M. S. C. ARANTES, O. M. N. FURLANETO, M. C. GODOY, L. P. OLIVEIRA, C. E. C. SATORI, D. VILAS-BOAS, L. A. WATANABE, M. A. E. DAMBROS, B. P. GUERRA, M. P. MATHIONI, S. M. SANTOS, K. L. STEINDEL, M. VERNAL, J. BARCELLOS, F. G. CAMPO, R. J. CHUEIRE, L. M. O. NICOLÁS, M. F. PEREIRA-FERRARI, L. SILVA, J. L. da C. GIOPPO, N. M. R. MARGARIDO, V. P. MENCK-SOARES, M. A. PINTO, F. G. S. SIMÃO, R. de C. G. TAKAHASHI, E. K. YATES, M. G. SOUZA, E. M.
Affiliation:	FÁBIO O. PEDROSA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ ROSE ADELE MONTEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ ROSELI WASSEM, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ LEONARDO M. CRUZ, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ RICARDO A. AYUB, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA NELSON B. COLAUTO, UNIVERSIDADE PARANAENSE, CAMPUS UMUARAMA MARIA APARECIDA FERNANDEZ, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ MARIA HELENA P. FUNGARO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA EDMUNDO C. GRISARD, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA MARIANGELA HUNGRIA DA CUNHA, CNPSO HUMBERTO M. F. MADEIRA8,, PONTIFÍCIA UNIVERSIDADE CATÓLICA DO PARANÁ, CAMPUS CURITIBA RUBENS O. NODARI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA CLARICE A. OSAKU, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO OESTE DO PARANÁ MARIA LUIZA PETZL-ERLER, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ HERNÁN TERENZI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA LUIZ G. E. VIEIRA, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ MARIA BERENICE R. STEFFENS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ VINICIUS A. WEISS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ LUIZ F. P. PEREIRA, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ MARINA I. M. ALMEIDA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ LYSANGELA R. ALVES, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ ANELIS MARIN, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ LUIZA MARIA ARAUJO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ EDUARDO BALSANELLI, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ VALTER A. BAURA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ LEDA S. CHUBATSU, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ HELISSON FAORO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ AUGUSTO FAVETTI, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ GERALDO FRIEDERMANN, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ CHIRLEI GLIENKE, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ SUSAN KARP, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ VANESSA KAVA-CORDEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ ROBERTO T. RAITTZ, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ HUMBERTO J. O. RAMOS, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ ENILZE MARIA S. F. RIBEIRO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ LIU UN RIGO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ SAUL N. ROCHA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ STEFAN SCHWAB, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ ANILDA G. SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ ELIEL M. SOUZA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ TADRA-SFEIR, M. Z., UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ RODRIGO A. TORRES, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ AUDREI N. G. DABUL, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA MARIA ALBERTINA M. SOARES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE PONTA GROSSA LUCIANO S. GASQUES, UNIVERSIDADE PARANAENSE, CAMPUS UMUARAMA CIELA C. T. GIMENES, UNIVERSIDADE PARANAENSE, CAMPUS UMUARAMA JULIANA S. VALLE, UNIVERSIDADE PARANAENSE, CAMPUS UMUARAMA RICARDO R. CIFERRI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ LUIZ C. CORREA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ NORMA K. MURACE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ JOÃO A. PAMPHILE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ ELIANA VALÉRIA PATUSSI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ ALBERTO J. PRIOLI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ SONIA MARIA A. PRIOLI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ CARMEM LÚCIA M. S. C. ROCHA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE MARINGÁ OLÍVIA MÁRCIA N. ARANTES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA MÁRCIA CRISTINA FURLANETO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA LEANDRO P. GODOY, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA CARLOS E. C. OLIVEIRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA DANIELE SATORI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA LAURIVAL A. VILAS-BOAS, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA MARIA ANGÉLICA E. WATANABE, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE LONDRINA BIBIANA PAULA DAMBROS, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA MIGUEL P. GUERRA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA SANDRA MARISA MATHIONI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA KARINE LOUISE SANTOS, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA MARIO STEINDEL, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA JAVIER VERNAL, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE SANTA CATARINA FERNANDO G. BARCELLOS RUBENS JOSE CAMPO, CNPSO LIGIA MARIA DE OLIVEIRA CHUEIRE, CNPSO MARISA FABIANA NICOLÁS LILIAN PEREIRA-FERRARI, PONTIFÍCIA UNIVERSIDADE CATÓLICA DO PARANÁ JOSÉ L. DA CONCEICÃO SILVA, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO OESTE DO PARANÁ NEREIDA M. R. GIOPPO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO OESTE DO PARANÁ VLADIMIR P. MARGARIDO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO OESTE DO PARANÁ MARIA AMÉLIA MENCK-SOARES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO OESTE DO PARANÁ FABIANA GISELE S. PINTO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO OESTE DO PARANÁ RITA DE CÁSSIA G. SIMÃO, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO OESTE DO PARANÁ ELIZABETE K. TAKAHASHI, INSTITUTO AGRONÔMICO DO PARANÁ MARSHALL G. YATES, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ EMANUEL M. SOUZA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO PARANÁ.
Date Issued:	2011
Citation:	PLoS Genetics, v. 7, n. 5, p. 1-10, may 2011.
Description:	The molecular mechanisms of plant recognition, colonization, and nutrient exchange between diazotrophic endophytes and plants are scarcely known. Herbaspirillum seropedicae is an endophytic bacterium capable of colonizing intercellular spaces of grasses such as rice and sugar cane. The genome of H. seropedicae strain SmR1 was sequenced and annotated by The Paraná State Genome Programme?GENOPAR. The genome is composed of a circular chromosome of 5,513,887 bp and contains a total of 4,804 genes. The genome sequence revealed that H. seropedicae is a highly versatile microorganism with capacity to metabolize a wide range of carbon and nitrogen sources and with possession of four distinct terminal oxidases. The genome contains a multitude of protein secretion systems, including type I, type II, type III, type V, and type VI secretion systems, and type IV pili, suggesting a high potential to interact with host plants. H. seropedicae is able to synthesize indole acetic acid as reflected by the four IAA biosynthetic pathways present. A gene coding for ACC deaminase, which may be involved in modulating the associated plant ethylene-signaling pathway, is also present. Genes for hemagglutinins/hemolysins/adhesins were found and may play a role in plant cell surface adhesion. These features may endow H. seropedicae with the ability to establish an endophytic life-style in a large number of plant species.
Thesagro:	Genoma Graminea tropical
NAL Thesaurus:	Genome Herbaspirillum seropedicae Nitrogen fixation Grasses
Keywords:	Fixação nitrogênio
DOI:	10.1371/journal.pgen.1002064
Type of Material:	Artigo de periódico
Access:	openAccess
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