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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/906232
Title: | Construção de uma biblioteca genômica de cromossomo artificial de bactéria de Coffea arabica. |
Authors: | CAÇÃO, S. M. B.![]() ![]() DINIZ, L. E. C. ![]() ![]() SILVA, N. V. ![]() ![]() VENIKY, F. ![]() ![]() ANDRADE, A. C. ![]() ![]() PEREIRA, L. F. P. ![]() ![]() VIEIRA, L. G. E. ![]() ![]() |
Affiliation: | SANDRA M. B. CAÇÃO, IAPAR; LEANDRO E. C. DINIZ, IAPAR; NATHALIA V. SILVA, IAPAR; FILIPE VENIKY, CENARGEN; ALAN CARVALHO ANDRADE, CENARGEN; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC; LUIZ GONZAGA E. VIEIRA, IAPAR. |
Date Issued: | 2007 |
Citation: | In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007. |
Description: | A produção de mapas físicos em plantas tem grande importância para estudos de genética e melhoramento. O passo inicial para produção destes mapas é a construção de bibliotecas genômicas com largos fragmentos de DNA, em vetores do tipo cromossomo artificial de bactéria (BAC) ou de levedura (YAC). Visando a produção de um mapa físico, o objetivo deste trabalho foi construir uma biblioteca genômica de BAC de café. Fragmentos de DNA de alto peso molecular de C. arabica híbrido de Timor cv. 832/2 foram clonados no vetor pCC1BAC e transformados em E. coli DH10B. Após transformação 57000 clones foram inicialmente obtidos e ordenados manualmente em placas de 96 poços. A biblioteca foi transferida em triplicata para placas de 384 poços, com equipamento Q-BOT, resultando em 55.778 clones em 148 placas. A verificação do tamanho do inserto de 130 clones revelou tamanho médio de 115-120 Kb. A cobertura do genoma haplóide estimada para C.arabica foi de cinco vezes. A validação da biblioteca presença de DNA de cloroplasto e mitocôndria, assim como a seleção inicial com sondas para iniciar o mapeamento físico, está sendo realizada através de hibridização de colônias em membranas contendo 18.462 clones em duplicata. |
Thesagro: | Clonagem |
NAL Thesaurus: | Coffea |
Keywords: | BAC Mapeamento |
Type of Material: | Artigo em anais e proceedings |
Access: | openAccess |
Appears in Collections: | Artigo em anais de congresso (SAPC)![]() ![]() |
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