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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/963655
Title: | Mineração de motivos SSR em sequências expressas de feijão-caupi contendo TAGS supersage diferecialmente expressas sob desidratação radicular. |
Authors: | SANTOS, R.![]() ![]() BASANTE, C. ![]() ![]() FERREIRA NETO, J. R. C. ![]() ![]() PANDOLFI, V. ![]() ![]() ROCHA, M. de M. ![]() ![]() SILVA, K. J. D. e ![]() ![]() NEPOMUCENO, A. ![]() ![]() BRONDANI, R. P. V. ![]() ![]() BENKO-ISEPPON, A. M. ![]() ![]() KIDO, E. A. ![]() ![]() |
Affiliation: | RENATO SANTOS, UFPE; CAROLINA BASANTE, UFRPE; JOSÉ R. C. FERREIRA NETO, UFPE; VALESCA PANDOLFI, UFPE; MAURISRAEL DE MOURA ROCHA, CPAMN; KAESEL JACKSON DAMASCENO E SILVA, CPAMN; ALEXANDRE NEPOMUCENO, CNPSO; ROSANA P. V. BRONDANI, CNPAF; ANA M. BENKO-ISEPPON, UFPE; EDERSON A. KIDO, UFPE. |
Date Issued: | 2013 |
Citation: | In: CONGRESSO NACIONAL DE FEIJÃO-CAUPI, 3., 2013, Recife. Feijão-Caupi como alternativa sustentável para os sistemas produtivos familiares e empresariais. Recife: IPA, 2013. |
Description: | O feijão-caupi é uma planta importante na nutrição e na economia de pequenos produtores das regiões Norte e Nordeste do Brasil. Entretanto, sua produtividade ainda é pequena, quando comparada com seu potencial e o de outras leguminosas. Uma das alternativas para auxiliar o melhoramento genético da cultura e associar tecnologias modernas, como o desenvolvimento de marcadores moleculares do tipo microssatélites (SSR) e a identificação de genes importantes em resposta a estresses, via estudos de transcriptômica, proporcionados pela técnica SuperSAGE. Nesse sentido, tags SuperSAGE de 26 pb, de genótipo tolerante a desidratação radicular, que foram observadas sendo induzidas após aplicação do estresse (até 150 min), em relação ao controle sem estresse, foram ancoradas em ESTs de feijão-caupi. Essas ESTs contendo as tags induzidas foram mineradas quanto à presença de motivos SSR. Os motivos identificados em 135 ESTs permitiram desenhar pares de primers para desenvolvimento de marcadores moleculares SSR, agora baseados em DNA, e não mais anônimos, visando aproveitar esse tipo de polimorfismos para genotipagem de materiais do melhoramento. Sua associação com resposta a estresses está sendo investigada. |
Thesagro: | Vigna Unguiculata |
Keywords: | Estresse abiótico Biblioteca genômica Bioinformática |
Notes: | CONAC 2012. Disponível em: http://www.conac2012.org/resumos/pdf/344a.pdf. Acesso em: 09 ago. 2013. |
Type of Material: | Artigo em anais e proceedings |
Access: | openAccess |
Appears in Collections: | Artigo em anais de congresso (CPAMN)![]() ![]() |