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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2012 | Busca computacional por grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva em Alphaherpesvirinae. | CASTRO, G. M. de  ; LOBO, F. P. |
| 2012 | Comparative transcriptome analysis of eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. | GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; TEIXEIRA, J.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. |
| 2013 | Counting RNAseq reads: which way is better? | SILVA, F. R. da; NODA, R. W.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; CARNEIRO, N. P. |
| 2015 | Daytime soybean transcriptome fluctuations during water deficit stress. | RODRIGUES, F. A.; FUGANTI-PAGLIARINI, R.; MARCOLINO-GOMES, J.; NAKAYAMA, T. J.; MOLINARI, H. B. C.; LOBO, F. P.; HARMON, F. G.; NEPOMUCENO, A. L. |
| 2014 | De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. |
| 2015 | de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). | LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
| 2014 | Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. | CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. |
| 2014 | Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. | CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. |
| 2011 | Desenvolvimento de software para a detecção de grupos de genes homólogos sob evidência de seleção positiva. | HONGO, J. A.; LOBO, F. P. |
| 2016 | Design of the ATAQ peptide and its evaluation as an immunogen to develop a Rhipicephalus vaccine. | AGUIRRE, A. de A. R.; LOBO, F. P.; ANDREOTTI, R. |
| 2012 | Detecção e análise bioinformática de genes sob evidência de seleção positiva em genomas de parasitos. | HONGO, J. A.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P. |
| 2016 | Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. | ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. |
| 2012 | Development of a computational pipeline to detect positive selection. | CINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. |
| 2014 | Draft genome sequence of the D-xylose-fermenting yeast Spathaspora arborariae UFMG-HM19.1AT. | LOBO, F. P.; GONÇALVES, D. L.; ALVES JÚNIOR, S. L.; GERBER, A. L.; VASCONCELOS, A. T. R. de; BASSO, L. C.; FRANCO, G. R.; SOARES, M. A.; CADETE, R. M.; ROSA, C. A.; STAMBUK, B. U. |
| 2012 | Draft genome sequencing of the Yeast Spathaspora arborariae sp. | SANTOS, E. de M.; FRANCO, G. R.; STAMBUK, B. J. C. U.; ROSA, C. A.; LOBO, F. P. |
| 2012 | Elaeis oleifera genome draft - genomics of american oil palm. | LIMA, R. S.; LOBO, F. P.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; RODRIGUES, E. L. de C.; ALVES, A. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SOUZA JUNIOR, M. T.; FORMIGHIERI, E. F. |
| 2013 | Embrapa Bioinformatic Multi-user laboratory. | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. |
| 2012 | Embrapa Bioinformatics Multi-Users Laboratory - LMB. | KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; HIGA, R.; VIEIRA, F. |
| 2012 | Enrichment of repeats in proteins of protozoan parasites relates to the ability to invade host cells and evade host immune response. | MENDES, T. A. de O.; LOBO, F. P.; RODRIGUES, T. S.; LUIZ, G. F. R.; ROCHA, W. D. da; FUJIWARA, R. T.; TEIXEIRA, S. M. R.; BARTHOLOMEU, D. C. |
| 2014 | Estudo de associação genômica empla utilizando Random Forest: estudo de caso em bovinos de corte. | HIGA, R. H.; MOKRY, F. B.; MUDADU, M. de A.; LOBO, F. P.; REGITANO, L. C. de A. |
