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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2010 | Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. | RIBEIRO, C.  ; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. |
| 2006 | Building multiple sequence alignments with a flavor of HSSP alignments. | HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2008 | "Cloud computation" na forma de serviços WEB para um banco de dados federativo STING_RDB. | NESHICH, G.; JARDINE, J. G.; BERNARDES, R.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; SILVEIRA, C. da |
| 2014 | Desenvolvimento de simuladores na agropecuária. | BARIONI, L. G.; MANCINI, A. L. |
| 2014 | Desenvolvimento de um jogo educativo baseado em um simulador de sistema de produção de bovinos de corte. | BORTOLUCCI JUNIOR, J.; MANCINI, A. L. |
| 2013 | Desenvolvimento do modelo de crescimento animal Oltjen na linguagem C++ usando o framework de simulação Macsim. | TININI, L. V. S.; MANCINI, A. L.; BARIONI, L. G. |
| 2015 | Especificação e instanciação de modelos matemáticos hierárquicos utilizando XML no framework de simulação MaCSim. | MANCINI, A. L.; BARIONI, L. G.; BORTOLUCCI JUNIOR, J.; TININI, L. V. S.; LEONARDI, J. J.; MINTO NETO, J. G. |
| 2013 | Um framework compacto e flexível em C++ para desenvolvimento modular de simulação de sistemas de hierarquia dinâmica. | SANTOS, J. W. dos; MANCINI, A. L.; BARIONI, L. G. |
| 2014 | Integração entre diferentes ferramentas de simulação. | TININI, L. V. S.; MANCINI, A. L. |
| 2013 | Modularização de aplicações utilizando biblioteca de vínculo dinâmico, Dynamic-link library (DLL). | ABREU, L. L. B. de; MANCINI, A. L.; BARIONI, L. G. |
| 2006 | PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. | FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G. |
| 2006 | Predicting enzyme class from protein structure using Bayesian classification. | BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. M.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; JARDINE, J. G.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; HIGA, R. H.; KUSER, P. R.; NESHICH, G. |
| 2014 | Proposta de um padrão de implementação de sistemas de equações diferenciais ordinárias em linguagem R. | ALMEIDA, M. P. de; MANCINI, A. L. |
| 2016 | Protocolo de criptografia simétrico baseado em permutações unidirecionais. | MINTO NETO, J. G.; CASTRO, A. de; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L. |
| 2015 | Protótipo de sistema de segurança criptográfica via porta lógica quântica. | MINTO NETO, J. G.; CASTRO, A. de; MANCINI, A. L. |
| 2017 | sdsim: um pacote para modelagem e simulação de sistemas dinâmicos contínuos em R. | BAZZANO, C. F.; PEREIRA, B. H.; BARIONI, L. G.; MANCINI, A. L.; NICOLAU, M. |
| 1995 | SISCOREB: sistema para controle de rebanho leiteiro. | MEIRA, C. A. A.; MANCINI, A. L.; MAXIMO, F. A.; FILETO, R.; PASSOS, S. L. Z.; MASSRUHÁ, S. M. F. S. |
| 2021 | Sistema de acompanhmento de investimentos para aumento da rentabilidade e sustentabilidade do setor sucroenergético. | YANO, I. H.; CASTRO, A. de; MANCINI, A. L.; SILVA, F. C. da |
| 2004 | Sting Millennium Suite: integrated software for extensive analyses of 3d structures of proteins and their complexes. | HIGA, R. H.; TOGAWA, R. C.; MONTAGNER, A. J.; PALANDRANI, J. C. F.; OKIMOTO, I. K. S.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2003 | STING Millennium: a web-based suite of programs for comprehensive and simultaneous analysis of protein structure and sequence. | NESHICH, G.; TOGAWA, R. C.; MANCINI, A. L.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; PAPPAS JUNIOR, G.; TORRES, W. V.; CAMPOS, T. F. e; FERREIRA, L. L.; LUNA, F. M.; OLIVEIRA, A. G.; MIURA, R. T.; INOUE, M. K.; HORITA, L. G.; SOUZA, D. F. de; DOMINIQUINI, F.; ÁLVARO, A.; LIMA, C. S.; OGAWA, F. O.; GOMES, G. B.; PALANDRANI, J. F.; SANTOS, G. F. dos; FREITAS, E. M. de; MATTIUZ, A. R.; COSTA, I. C.; ALMEIDA, C. L. de; SOUZA, S.; BAUDET, C.; HIGA, R. H. |
