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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2018 | Back to the roots: revealing beneficial interactions between the rhizosphere microbiome and wild wheat. | ROSSMANN, M.  ; PÉREZ-JARAMILLO, J. E.; CHIARAMONTE, J. B.; KAVAMURA, V. N.; DUMACK, K.; FIORE-DONNO, A. M.; MENDES, L. W.; BONKOWSKI, M.; MAUCHLINE, T.; RAAIJMAKERS, J. M.; MENDES, R. |
| 2008 | Bactérias isoladas da rizosfera de Rhizophora mangle usadas no biocontrole de Pythium aphanidermathum. | SOARES JÚNIOR, F. L.; MENDES, R.; MATTOS, L. V. de; PINTO, Z. V.; CANOVA, S. P.; MELO, I. S. de |
| 2014 | Biodiversidade e bioprospecção de micro-organismos na Caatinga. | MELO, I. S. de; MORAES, L. A. B.; QUEIROZ, S. C. do N. de; MENDES, R.; FIORE, M. de F.; PELLIZARI, V. H.; TAKETANI, R. G.; MELO, S.; SOUZA, A. O. de; KAVAMURA, V.; SANTOS, S. N.; OLIVEIRA, V. M.; NAKAYAMA, C. R. |
| 2023 | Bioprospection and extracts chemical characterization of plant growth promoting bacteria and antagonists of agricultural pests. | MACEDO, E. de M.; MENDES, R.; ANGOLINI, C. F. F. |
| 2018 | Breeding for resistance to soil-borne pathogen impacts rhizosphere microbiome functions in common bean. | MENDES, L. W.; MENDES, R.; RAAIJMAKERS, J. M.; TSAI, S. M. |
| 2015 | Composition and functionality of the wild and cultivated common bean rhizosphere microbiome. | FLORES, S. W. S.; CHIARAMONTE, J. B.; ROSSMANN, M.; MENDES, R. |
| 2015 | Composition of fungal communities in soil and endophytic in raspberry production systems. | ROMAGNOLI, E. M.; MENDES, R.; DUNLAP, C. |
| 2008 | O consumo de produtos agroecológicos no Acre. | SIVIERO, A.; ABREU, L. S. de; MENDES, R.; GOMES, F. C. da R. |
| 2008 | O consumo de produtos agroecológicos no Acre. | SIVIERO, A.; ABREU, L. S. de; MENDES, R.; GOMES, F. C. da R. |
| 2015 | Cross-kingdom similarities in microbiome ecology and biocontrol of pathogens. | BERG, G.; KRAUSE, R.; MENDES, R. |
| 2014 | Deciphering microbial landscapes of fish eggs to mitigate emerging diseases. | BRUIJN, I.; LIU, Y.; JACK, A. L. H.; DRYNAN, K.; BERG, A. H.; THOEN, E.; SANDOVAL-SIERRA, V.; SKAAR, I.; WEST, P.; VOORT, M. van der; MENDES, R.; MAZZOLA, M.; RAAIJMAKERS, J. |
| 2019 | Deciphering rhizosphere microbiome assembly of wild and modern common bean (Phaseolus vulgaris) in native and agricultural soils from Colombia. | PEREZ-JARAMILLO, J. E.; HOLLANDER, M. de; RAMÍREZ, C. A.; MENDES, R.; RAAIJMAKERS, J. M.; CARRIÓN, V. J. |
| 2013 | Deep into to the bacterial communities living in sheep rumen. | ROMAGNOLI, E. M.; NATEL, A. S.; FAGUNDES, G. G.; DURRER, A.; TAKETANI, R. G.; LOUVANDINI, H; ABDALLA, A. L.; MENDES, R. |
| 2013 | Descoberta da dinâmica do microbioma da rizosfera de mandacaru na caatinga. | FERREIRA, C.; TAKETANI, R. G.; SILVA, J. L. da; GAVA, C. A. T.; LOPES, L. D.; MELO, I. S. de; MENDES, R. |
| 2023 | Diversity of viruses and viroids in the rhizosphere of common bean cultivars differing in resistance to the fungal root pathogen Fusarium oxysporum. | BRAGA, L. P.; TANENTZAP, A. J.; LEE, B.; TSAI, S. M.; RAAIJMAKERS, J. M.; MENDES, R.; MENDES, L. W. |
| 2013 | Draft genome sequence of Pseudomonas sp. strain CMAA 1215, a plant growth-promoting bacterium isolated from a Brazilian mangrove. | VASCONCELLOS, R. L. F.; MENDES, R.; TAKETANI, R. G.; ZUCCHI, T. D.; MELO, I. S. de |
| 2014 | Dynamics of cacti rhizosphere bacterial communities in the Brazilian semiarid climate. | KAVAMURA, V. N.; FERREIRA, C.; TAKETANI, R. G.; MELO, I. S. de; MENDES, R. |
| 2016 | Dynamics of sheep rumen microbiome and its relationship with the degradation of biomass. | ROMAGNOLI, E. M.; DUNLAP, C.; LOUVANDINI, H.; TSAI, S. M.; ABDALLA, A. L.; MENDES, R. |
| 2014 | Efeito da temperatura na produção de conídios e peritécios de Neonectria ditissima em ramos destacados de macieira. | MENDES, R.; NUNES, C. C.; LIMA, F. V. de; SILVA, V. C. da; ALVES, S. A. M. |
| 2017 | Efeito do aquecimento global sobre a comunidade microbiana do solo. | MENDES, R.; TAKETANI, N. F.; TAKETANI, R. G. |
