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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2018 | A draft genome assembly for the forage grass Urochloa ruziziensis based on single-molecule real-time sequencing. | PESSOA FILHO, M. A. C. de P.  ; SOUZA SOBRINHO, F. de; FRAGOSO, R. da R.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FERREIRA, M. E. |
| 2015 | A flexible multi-species genome-wide 60K SNP chip developed from pooled resequencing of 240 Eucalyptus tree genomes across 12 species. | SILVA JUNIOR, O. B. da; FARIA, D. A.; GRATTAPAGLIA, D. |
| 2021 | Age trends in genetic parameters for growth performance across country-wide provenances of the iconic conifer tree Araucaria angustifolia show strong prospects for systematic breeding and early selection. | RESENDE, R. T.; SILVA, P. I. T.; SILVA JUNIOR, O. B. da; FREITAS, M. L. M.; SEBBENN, A. M.; SOUSA, V. A. de; AGUIAR, A. V. de; GRATTAPAGLIA, D. |
| 2018 | Analyses of cupuassu (Theobroma grandiflorum) transcriptome during interaction with Moniliophthora perniciosa, the causal agent of Witches' Broom disease. | FALCAO, L. L.; WERNECK, J. O. S.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; GRYNBERG, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ALVES, R. M.; ALBUQUERQUE, P. S. B.; MARCELLINO, L. H. |
| 2013 | Analysis of the leaf transcriptome of Musa acuminata during interaction with Mycosphaerella musicola: gene assembly, annotation and marker development. | PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. O. de; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. C. de; AZEVEDO, V. C. R.; BRASILEIRO, A. C. M.; AMORIM, E. P.; FERREIRA, C. F.; MARTINS, N. F.; TOGAWA, R. C.; PAPPAS JÚNIOR, G. J.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MILLER, R. T N. G. |
| 2018 | Analysis of the transcriptome in Aspergillus tamarii during enzymatic degradation of sugarcane bagasse. | MIDORIKAWA, G. E. O.; CORREA, C. L.; NORONHA, E. F.; FERREIRA FILHO, E. X.; TOGAWA, R. C.; COSTA, M. M. do C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRYNBERG, P.; MILLER, R. N. G. |
| 2018 | Application of the Axiom 3K SNP genotyping array in cassava breeding and genetics. | PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SILVA, P. I. T.; RESENDE, L. V.; VIEIRA, E. A.; FALEIRO, F. G.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da |
| 2018 | Coupling in-depth genome annotations with genome editing technology for harnessing genomic variation to promote precision breeding in tropical soybean. | SILVA JUNIOR, O. B. da; PESSOA FILHO, M. A. C. de P.; SA, M. E. L.; DEAL, R.; RAGOUSSIS, I.; GRATTAPAGLIA, D.; RECH FILHO, E. L. |
| 2014 | Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. | RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. |
| 2014 | Desenvolvimento de novos microssatélites em Araucaria angustifolia via redução de complexidade genômica e sequenciamento. | RESENDE, L. V.; SOUSA, V. A. de; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D. |
| 2019 | Desenvolvimento e validação de uma plataforma de genotipagem em larga escala para Coffea canéfora. | CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. |
| 2017 | Desenvolvimento e validação do chip de genotipagem 26K Axiom® SNP array em Coffea canephora. | CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. |
| 2018 | Design and evaluation of a sequence capture systemfor genome-wide SNP genotyping in highly heterozygous plant genomes: a case studywith a keystone Neotropical hardwood tree genome. | SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; NOVAES, E.; COLLEVATTI, R. G. |
| 2017 | Development and validation of a 26K Axiom® SNP array for Coffea canephora. | CARNEIRO, F. de A.; MARRACCINI, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. |
| 2012 | Development of expressed sequence tag and expressed sequence tag-simple sequence repeat marker resources for Musa acuminata. | PASSOS, M. A. N.; CRUZ, V. de O.; EMEDIATO, F. L.; TEIXEIRA, C. de C.; SOUZA JUNIOR, M. T.; MATSUMOTO, T.; AZEVEDO, V. C. R.; FERREIRA, C. F.; AMORIM, E. P.; FIGUEIREDO, L. F. de A.; MARTINS, N. F.; CAVALCANTE, M. de J. B.; BAURENS, F. C.; SILVA JUNIOR, O. B. da; PAPPAS JUNIOR, G. J.; PIGNOLET, L.; ABADIE, C.; CIAMPI, A. Y.; PIFFANELLI, P.; MILLER, R. N. G. |
| 2015 | Estrutura e diversidade genética de uma população de Coffea canephora conilon utilizando marcadores SNPs identificados por nextRAD. | CARNEIRO, F. de A.; RÊGO, É. C. S.; AQUINO, S. O. de; COSTA, T. S.; LIMA, E. A. de; ROCHA, O. C.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; MARRACCINI, P.; BARTHOLO, G. F.; GUERRA, A. F.; SILVA JUNIOR, O. B. da; GRATTAPAGLIA, D.; ANDRADE, A. C. |
| 2019 | Estudo de associação genômica ampla para importantes características agronômicas em Coffea canephora. | CARNEIRO, F. de A.; AQUINO, S. O. de; MATTOS, N. G.; VALERIANO, J. C.; CARNEIRO, W. W. de J.; RODRIGUES, G. C.; CARVALHO, M. A. de F.; VEIGA, A. D.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da; MARRACCINI, P.; VIEIRA JUNIOR, I. C.; BALESTRE, M.; ANDRADE, A. C. |
| 2012 | Gene expression revealed during the interaction of resistant Arachis stenosperma and Meloidogyne arenaria. | GUIMARAES, P. M.; MORGANTE, C. V.; ROBERTS, P. A.; SILVA JUNIOR, O. B. da; ARRAIS, L; BERTIOLI, S. C. de M. L.; ARAUJO, A. C. G. de; MORETZSOHN, M. de C.; BERTIOLI, D.; BRASILEIRO, A. C. M. |
| 2019 | Genetic analysis of growth curves of individual trees and country-wide provenances of Araucaria angustifolia shows huge potential for enhanced domestication, breeding and conservation of this iconic Brazilian conifer. | RESENDE, R. T.; TANNO, P.; SILVA JUNIOR, O. B. da; AGUIAR, A. V. de; SOUSA, V. A. de; SEBBENN, A.; GRATTAPAGLIA, D. |
| 2022 | Genetic associations with resistance to Meloidogyne enterolobii in guava (Psidium sp.) using cross-genera SNPs and comparative genomics to Eucalyptus highlight evolutionary conservation across the Myrtaceae. | SANTOS, C. A. F.; COSTA, S. R. da; BOITEUX, L. S.; GRATTAPAGLIA, D.; SILVA JUNIOR, O. B. da |
