https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/item/300 Tese/dissertação (CENARGEN) 2026-04-23T01:54:32Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1170714 Título: Análise genômica de regiões associadas a determinação do sexo em tambaqui (Colossoma macropomum). Autoria: SILVA, N. M. L. Conteúdo: O objetivo desta tese foi identificar o gene mestre determinante do sexo (MSD) do tambaqui e obter um teste molecular simples, de 100% de acurácia, para identificar o sexo genotípico da espécie. Foram identificados SNPs determinantes do sexo no tambaqui, e a região genômica em que esses marcadores moleculares foram encontrados foi investigada com o sequenciamento dos genes mestres candidatos. Os dados genotípicos de 192 amostras genotipadas com o chip de média densidade Axiom SerraSNP foram utilizados no presente estudo. A associação genômica ampla (GWAS) identificou cinco regiões genômicas associadas ao sexo no tambaqui. Os genótipos de todos os SNPs indicaram um sistema genético XX/XY. O grupo de ligação e a posição desses SNPs foram localizados no genoma referência do tambaqui (NCBI: GCF_904425465.1). Esses marcadores foram encontrados em íntrons dos genes znrf2b, zgc:158766 e LOC118799143 e em uma região próxima ao gene bHLH. Primers foram desenhados em íntrons e éxons dos genes znrf2b e bHLH e em éxons dos genes fzd1 e nod1, sendo que esses dois últimos genes estavam localizados próximos ao znrf2b. PCRs foram feitas com os primers utilizando um subconjunto de amostras de doze machos e doze fêmeas. Esse subconjunto é proveniente dos dados genotípicos das 192 amostras. Foi feita mais uma análise de GWAS com os SNPs recém-descobertos e com os marcadores do AxiomSerraSNP. Cinco SNPs recém-descobertos estavam associados ao sexo. Os marcadores que apresentaram maior acurácia estavam localizados nos íntrons do gene znrf2b e no éxon do nod1. O SNP encontrado no nod1 é responsável por uma variação no códon do RNAm (TGC e TGT), no entanto as duas trincas de bases codificam um mesmo aminoácido, que é a cisteína. Os primers desenhados no éxon do gene bHLH amplificaram o fragmento de DNA principalmente nos machos. Os resultados indicam que algum dos genes (znrf2b, bHLH, fzd1 ou nod1) pode ser o mestre da determinação do sexo em tambaqui, uma vez que não foi possível sequenciar todos os éxons desses genes devido à ausência de amplificação das sequências-alvo (dentre os 26 primers desenhados nos genes, somente 15 amplificaram o fragmento de DNA). Sendo assim, é necessário a realização de estudos complementares que explorem ainda mais essas regiões para compreender melhor os mecanismos de determinação e diferenciação do sexo em tambaqui. 2024-01-01T00:00:00Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1168221 Título: Criopreservação de calos e respostas à indução da embriogênese somática e à regeneração de plantas em múltiplos acessos de cacaueiro (Theobroma cacao L.). Autoria: SANTOS, M. C. A. dos Conteúdo: O Brasil abriga um dos maiores Bancos de Germoplasma de cacaueiro do mundo, com mais de 4.500 acessos conservados em campo. No entanto, esses acessos estão ameaçados por condições ambientais adversas. Este estudo teve como um dos objetivos avaliar estratégias de conservação ex situ de cacaueiros por meio da criopreservação de calos a partir de diferentes acessos, tipos de explantes e métodos de criopreservação. Num segundo momento, o trabalho se propôs a avaliar o efeito genotípico de 24 genótipos de cacaueiros quanto a indução da embriogênese somática e regeneração de plantas. No primeiro experimento, acessos comerciais (CCN-51, CEPEC 2002 e PH 16) e não comerciais (752 e 762) foram estudados, utilizando explantes de estaminódios inteiros e a parte basal dos estaminódios. Analisaram-se pré-tratamentos de criopreservação, como pré-cultivo em sacarose e tempos de imersão em soluções de vitrificação (PVS2) e técnicas como vitrificação, droplet vitrification e slow cooling. O potencial embriogênico e reações adversas também foram avaliados. Os resultados mostraram que, no pré-cultivo em sacarose, os genótipos comerciais apresentaram altas taxas de sobrevivência de calos, com destaque para CCN-51 e CEPEC 2002, que atingiram 100%. Na imersão em loading solution, o genótipo 752 obteve 100% de formação de calos em tempos de imersão mais longos. Nos experimentos de imersão em PVS2 e nitrogênio líquido (NL), observou-se uma redução significativa na viabilidade de calos, especialmente em explantes oriundos de partes basais. Na droplet vitrification, foram encontrados mais calos com células embriogênicas, embora houvesse a presença de oxidação em grande parte das amostras. No segundo experimento, foram avaliados 24 genótipos quanto à embriogênese somática. A análise fenotípica revelou variações de coloração nos botões florais e estaminódios. A formação de calos variou significativamente entre os genótipos, com destaque para aqueles que apresentaram calos granulares e nodulares. Após 35 dias, observou-se formação de embriões somáticos, que se desenvolveram principalmente na base dos estaminódios. O genótipo 4025 M153 se destacou com 330 embriões formados, porém, muitos embriões apresentaram má formação, necessitando de ajustes nos protocolos. Conclui-se que a criopreservação em ultrabaixas temperaturas manteve a viabilidade dos calos, mas futuras otimizações são necessárias. A embriogênese somática também revelou variações genotípicas, sugerindo que ajustes nos protocolos podem melhorar a regeneração de plantas completas. 2024-01-01T00:00:00Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1168223 Título: Estabelecimento de culturas em suspensão de Euterpe precatoria MART. (Arecaceae). Autoria: VASCONCELOS, A. D. M. Conteúdo: A palmeira Euterpe precatoria Mart. (açaí-solteiro), conhecida mundialmente possui grande importância econômica no Brasil. Originário da Floresta Amazônica, é consumido como alimento básico por muitas comunidades na região. O açaí é uma palmeira que vai além dos seus usos tradicionais devido sua relevância nutricional e seus benefícios para a saúde humana. O açaí é uma palmeira tão importante para nutrição humana, que recebeu outro título, o de “super fruto”, tornando-a ainda mais importante economicamente. O fruto ganhou reconhecimento internacionalmente devido às suas propriedades energéticas e sua riqueza em minerais, ácidos graxos, antocianinas e antioxidantes. Essas características têm impulsionado o consumo da polpa de açaí nos últimos anos. Assim, objetivou-se, nesta pesquisa, estabelecer linhagens embriogênicas em meio de consistência líquida (suspensão celular) e avaliar a cinética do crescimento de estruturas embriogênicas de E. precatoria Mart, oriundas de embriões zigóticos, tecidos foliares jovens e inflorescências imaturas. É importante destacar que, até agora, não há relatos na literatura sobre o uso dessa técnica para a reprodução dessa espécie. No primeiro artigo, avaliou-se o crescimento oito linhagens (L1-L6 e L8), oriundas de tecidos foliares, embriões zigóticos e inflorescência imaturas, em meio líquido (500 mg calos embriogênicos) de MS suplementados com 5 μM Picloram (5 linhagens) e, para fins comparação em meio semissólido (1,050 g de calo embriogênico) de MS suplementado com 13,57 μM Picloram (3 linhagens). A curva de crescimento foi obtida a partir da pesagem dos calos entre 60 até 180 dias de cultivo. O modelo Gompertz foi aplicado e a cinética de crescimento foi avaliada. Aos 100 dias, verificaram-se o teor de açúcares e proteínas solúveis totais. O cultivo de linhagens de E. precatoria em meio de consistência líquida foi realizado com sucesso e o estabelecimento foi obtido. As linhagens apresentaram diferenças estatísticas na curva de crescimento. Foi verificada a ausência da fase lag (dia). O modelo de Gompertz pode ser adequado, uma vez que descreve mais de 90% da cinética de crescimento das linhagens. A análise multivariada revela elevado incremento de massa em culturas líquidas, representadas pelas linhagens L6 e L2. Diferenças estatísticas foram constatadas nos teores de Açúcares Solúveis Totais (AST), e os maiores níveis foram observados nas linhagens cultivadas em meio líquido. O teor de proteínas encontrado foi muito baixo, apesentando diferenças estatísticas entre as linhagens. A multiplicação apresenta comportamento ao longo dos subcultivos, tanto entre linhagens quanto entre períodos de cultivo. No segundo artigo, avaliouse a otimização do protocolo, utilizando materiais somáticos de origem foliar. Seis linhagens (LT1- LT6) foram avaliadas em seis meios diferentes, sendo os meios respectivamente PIC; PIC+AIB: PIC+ANA; 2,4-D; 2,4-D+AIB e 2,4-D+ANA. Avaliaram-se, ao longo de 180 dias de cultivo, a oxidação, o volume e contaminação. A análise dos componentes principais foi estimada. O modelo Gompertz foi aplicado e a cinética do crescimento foi determinada. O protocolo foi otimizado com sucesso. Os resultados obtidos foram acima do esperado, tendo uma taxa de crescimento médios acima dos 1.400%. Aos 100 dias, verificou-se que os calos apresentaram competência embriogênica. A dinâmica de crescimento foi variável entre as linhagens. As linhagens apresentaram diferenças estatísticas na curva de crescimento. A fase lag (dia) foi determinada neste estudo. O modelo de Gompertz pode ser adequado, com curvas sigmoides uma vez que descreve mais de 70% da cinética de crescimento das linhagens. A análise multivariada revela que há similaridade entre as linhagens. O protocolo de cultivos de açaí-solteiro em meio de consistência líquida foi otimizado. A produção de calos embriogênicos friáveis foi melhorada. As linhagens apresentaram diferença significativa em razão do efeito das composições dos meios de cultivo ao longo do tempo. A oxidação não impede a produção de calos embriogênicos friáveis. Os calos podem ser multiplicados tanto usando auxina Picloram quanto 2-4-D. As análises anatômicas revelam que os calos têm competência embriogênica. 2024-01-01T00:00:00Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1087736 Título: Conservação de sementes de espécies da subtribo Hyptidinae (Lamiaceae) nativas do semiárido baiano. Autoria: FERRAZ, M. Conteúdo: A caatinga é um bioma com uma grande diversidade biológica, endemismos egrande potencial para produção de compostos bioativos de interesse econômico, porém com uma grande carência de informações sobre as espécies vegetais e suas formas de conservação.Neste trabalho, com o objetivo de diminuir essa carência e garantir sua conservação genética, oito espécies da subtribo Hyptidinae (Lamiaceae):Eplingiella fruticosa (Salzm. ex Benth.) Harley & J.F.B.Pastore, Gymneia platanifolia (Salzm. ex Benth.) Harley & J.F.B.Pastore, Hyptis lanceolata Poir., Hyptis ramosa Pohl ex Benth.,Hyptis velutina Pohl ex Benth.,Martianthus leucocephalus (Salzm. ex Benth.) J.F.B.Pastore, Mesosphaerum pectinatum (L.) Kuntze, Mesosphaerum suaveolens (L.) Kuntze., tiveram as sementes caracterizadas, foi feita a extração da mucilagem e o armazenamento por vinte e quatro meses em quatro ambientes distintos: 10°C sem controle de umidade, a 10°C e 25°C com solução saturada de cloreto de zinco, e em nitrogênio líquido a -196 °C. A cada três meses foi testada a resposta germinativa para avaliar a eficiência do armazenamento na conservação das sementes. Foi testada a eficácia do uso de imagem de raio X na avaliação da qualidade das sementes armazenadas.O teor de umidade das sementes variou de 1,98% a 8,05%, adequados ao armazenamento.E. fruticosa, M. pectinatum e M. suaveolens podem vir a ser boas fontes de mucilagem por apresentar alto rendimento.Os ambientes com baixa umidade relativa (5,5%) mantida pelo cloreto de zinco se mostraram eficientes no armazenamento das sementes de cinco das oito espécies avaliadas mantendo a viabilidade durante o período avaliado. A análise da imagem de raio X é eficaz na avaliação da qualidade das sementes. 2016-01-01T00:00:00Z