https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/item/102 Tese/dissertação (CPAA) Mon, 06 Apr 2026 22:57:29 GMT 2026-04-06T22:57:29Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1185816 Título: Desenvolvimento de soluções biotecnológicas antiparasitárias voltadas ao controle Neoechinorhynchus buttnerae a partir de bactérias quitinolíticas oriundas de sedimentos dos rios Amazônicos. Autoria: CALDAS, L. F. G. de S. Conteúdo: A aquicultura figura entre os setores de produção de alimentos de origem animal que mais crescem no mundo, mas sua expansão é fortemente limitada pela ocorrência de doenças parasitárias. No Brasil, a criação de tambaqui (Colossoma macropomum) é ameaçada pela acantocefalose, causada pelo parasita intestinal Neoechinorhynchus buttnerae, enfermidade que atualmente, não existem terapias plenamente eficazes e ambientalmente seguras, o que à torna um dos principais entraves sanitários à expansão sustentável da piscicultura nacional. Para suprir essa lacuna, o presente estudo investigou o potencial biotecnológico de 37 linhagens de bactérias quitinolíticas isoladas de sedimentos da bacia amazônica, integrando abordagens complementares de triagem fenotípica in vitro e mineração genômica in silico. Os resultados revelaram que 18 isolados apresentaram atividade contra o acantocéfalo N. buttnerae, com destaque para a linhagem Streptomyces amazonensis MAD 27, que demonstrou alta eficiência, induzindo 100% de mortalidade em N. buttnerae em apenas 2 a 5 horas, um desempenho equivalente ao controle positivo (cloridrato de levamisol). A análise comparativa com extratos confirmou a presença de metabólitos secundários bioativos, sugerindo um mecanismo de ação multifacetado que pode envolver a ação enzimática e a liberação de compostos. Testes comparativos com culturas vivas e autoclavadas das linhagens mais eficazes demonstraram que a atividade é termolábil e dependente da integridade e/ou atividade metabólica do microrganismo. A análise genômica das linhagens mais promissoras forneceu a base molecular para possivelmente explicar sua eficácia, revelando Clusters Gênicos Biossintéticos (BGCs) responsáveis pela produção de metabólitos já conhecidos por apresentarem atividade antiparasitária, incluindo Policetídeos (como a Antimicina, um potente inibidor mitocondrial) e Peptídeos Não Ribossomais (como a Actinomicina D, um inibidor de DNA/RNA). A presença destes BGCs sugere que a alta letalidade observada pode ser mediada por mecanismos de ação direcionados a alvos vitais do parasita. Este trabalho estabelece a linhagem Streptomyces amazonensis MAD 27 como um candidato de primeira linha para o desenvolvimento de soluções biotecnológicas sustentáveis, seja como bioterápico de cultura viva ou como fonte de novos fármacos. A abordagem integrada fenotípica-genômica valida bactérias de sedimentos de rios como um reservatório de diversidade química para o combate parasitário na aquicultura, oferecendo uma alternativa ecologicamente mais segura aos tratamentos convencionais. Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1185816 2025-01-01T00:00:00Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1184073 Título: Avaliação do papel das árvores grandes para o manejo florestal sustentável. Autoria: MARQUES, P. E. O. Conteúdo: As árvores grandes (DAP ≥ 60 cm) contribuem com a estrutura e a dinâmica das florestas, desempenham papeis ecológicos importantes para o funcionamento do ecossistema e geralmente representam a maior parte do conjunto de árvores exploradas para obtenção de madeira em tora. O presente estudo investigou as contribuições ecológicas das árvores grande em floresta ombrófila densa, explorada há 23 anos, no Estado do Amazonas, a partir da avaliação de sua influência na produção madeireira, estoque de biomassa e na estrutura do ecossistema. Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1184073 2025-01-01T00:00:00Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1182268 Título: Descrição e caracterização de novas espécies amazônicas de Trichoderma com aplicações na agricultura e biotecnologia. Autoria: SOUSA, T. F. Conteúdo: O gênero Trichoderma é amplamente reconhecido por seu papel crucial na agricultura moderna, devido à sua capacidade de promover o crescimento de plantas e controlar doenças de forma sustentável e ecológica. Com mais de 500 espécies válidas descritas, o crescente número de sequenciamentos genômicos tem revelado um vasto repertório de enzimas e metabólitos com grande potencial biotecnológico. Na presente tese, diferentes abordagens taxonômicas, funcionais e genômicas foram aplicadas para a caracterização de linhagens de Trichoderma isoladas de ambientes amazônicos, resultando na descrição de novas espécies e na identificação de compostos bioativos relevantes. No primeiro estudo, foi isolada e caracterizada uma nova espécie, Trichoderma agriamazonicum, a partir de Scleronema micranthum (Malvaceae). A identificação baseou-se em análises morfológicas e filogenéticas, sendo corroborada por estudos funcionais que demonstraram a capacidade do fungo de inibir o crescimento de diversos fitopatógenos por micoparasitismo e produção de compostos voláteis (VOCs). Ensaios in vivo em frutos de Capsicum chinense mostraram o controle eficaz da podridão causada por Colletotrichum scovillei. As análises químicas e genômicas revelaram a produção de metabólitos inéditos e a presença de numerosos clusters biossintéticos, evidenciando o potencial biotecnológico da nova espécie. No segundo estudo, foram caracterizadas 43 linhagens de Trichoderma isoladas de sedimentos de rios amazônicos. A análise filogenética baseada no gene tef1-α identificou 15 espécies, incluindo a descrição de cinco novas espécies e o primeiro registro de duas espécies no Brasil. Ensaios de antagonismo in vitro demonstraram o potencial de várias linhagens como agentes de biocontrole, resultado que foi validado por testes in vivo em sementes de feijão-caupi. A prospecção genômica dessas linhagens revelou uma diversidade de clusters biossintéticos associados à produção de metabólitos antifúngicos, antibacterianos e citotóxicos. Os resultados obtidos destacam a riqueza da biodiversidade de Trichoderma na Amazônia e reforçam o potencial dessas novas espécies como fontes de biocontrole e de compostos bioativos, contribuindo para o desenvolvimento de alternativas sustentáveis para a agricultura e para futuras aplicações biotecnológicas. Wed, 01 Jan 2025 00:00:00 GMT https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1182268 2025-01-01T00:00:00Z https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1182278 Título: Mineração genômica e identificação de moléculas com potencial biotecnológico da microbiota amazônica. Autoria: FONSECA, J. S. da Conteúdo: A Amazônia, com sua vasta biodiversidade, abriga uma rede complexa de ecossistemas interconectados por rios como o Negro e o Solimões. Esta dinâmica única favorece o surgimento e a diversificação de linhagens microbianas, tornando a região um hotspot para a descoberta de soluções biológicas inovadoras. Partindo deste contexto, esta tese investigou o potencial biotecnológico de 36 bactérias isoladas de sedimentos dos rios amazônicos, com foco em aplicações no biocontrole de fitopatógenos e na promoção do crescimento vegetal. Os isolados bacterianos, foram avaliados in vitro contra fitopatógenos de importância agrícola, como Corynespora cassiicola, Colletotrichum siamense, Rhizoctonia solani e Ralstonia solanacearum. Esta seleção inicial deu origem a dois capítulos principais: o primeiro investiga o biocontrole de R. solanacearum, enquanto o segundo examina o potencial genômico e as aplicações agrícolas de Alcaligenes nematophilus SOL109. No capítulo 1, três isolados - Priestia aryabhattai RN 11, Streptomyces sp. RN24eKitasatospora sp. SOL 195 - demonstraram notável eficácia contra R. solanacearum, com inibição in vitro de 87-100%, redução da incidência da doença em 40-90% em mudas de tomateiro e promoção do crescimento das plantas. Análises filogenômicas baseadas em ANI e dDDH revelaram que RN 11 pertence à espécie Priestia aryabhattai (ANI: 98,61%, dDDH: 88,3%), enquanto RN 24 e SOL195apresentaram valores abaixo dos pontos de corte para novas espécies, sendo potencialmente novas espécies dos gêneros Streptomyces e Kitasatospora, respectivamente. O capítulo 2 revela o potencial multifacetado de A. nematophilus SOL 109, incluindo a inibição in vitro de 74 a 93% contra os fungos fitopatogênicos. A avaliação em casa de vegetação indica que a linhagem SOL 109 foi capaz de controlar o patógeno R. solani e promover o crescimento em tomateiros. Análises genômicas e químicas de SOL 109 identificaram clusters de genes biossintéticos (BGCs) únicos e compartilhados no gênero Alcaligenes, genes de resistência a antibióticos e metais pesados, e metabólitos com propriedades antimicrobianas. Os resultados desta tese destacam o potencial inexplorado dos microrganismos aquáticos amazônicos, revelando novas espécies de actinobactérias (RN24 e SOL195) e relatando pela primeira vez a ocorrência de A. nematophilus no Brasil. Este estudo contribui significativamente para o desenvolvimento de estratégias sustentáveis de manejo de doenças em plantas, oferece insights valiosos sobre o metabolismo secundário do gênero Alcaligenes e abre novas perspectivas para aplicações biotecnológicas na agricultura, reforçando a importância da conservação e estudo da biodiversidade microbiana amazônica. Mon, 01 Jan 2024 00:00:00 GMT https://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1182278 2024-01-01T00:00:00Z