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Unidade da Embrapa/Coleção:: Embrapa Informática Agropecuária - Resumo em anais de congresso (ALICE)
Data do documento: 15-Mar-2010
Tipo do Material: Resumo em anais de congresso (ALICE)
Autoria: HERAI, R. H.
YAMAGISHI, M. E. B.
Informaçães Adicionais: ROBERTO H. HERAI, Doutorando em Genética e Biologia Molecular/UNICAMP; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA.
Título: Uma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas.
Edição: 2009
Fonte/Imprenta: Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009.
Idioma: pt_BR
Notas: Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
Palavras-chave: Ferramenta Web
Sequências repetitivas em lócus gênico
Bioinformática
RepGraph
Genômica
Conteúdo: Sequências repetitivas (SR) em lócus gênico de animais e plantas podem estar envolvidas em diversos fenômenos biológicos, como interferência por RNAi (Fire et al., 1998) e trans-splicing (Di Segni et al., 2008). A maioria das SR localiza-se em regiões de introns e, usualmente, seus estudos envolvem apenas sequências de mRNA, sendo necessário a estrutura intron-exon dos genes. Desta forma, é preciso realizar um mapeamento dos genes em seu respectivo genoma de referência para identificação de quatro tipos de SR: repetição reversa e complementar, repetição direta e complementar, repetição reversa e repetição direta. Este trabalho apresenta uma ferramenta WEB, chamada RepGraph, a qual integra algoritmos e ferramentas de bioinformática para identificar os pares que formam cada tipo de SR e uma representação gráfica para ilustrar sua relação em dois lócus gênicos.
NAL Thesaurus: Web tool
Bioinformatics
Genomics
Ano de Publicação: 2009
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