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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2011 | Computational investigations in eukaryotes genome de novo assembly using short reads. | CINTRA, L. C.  |
| 2014 | De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. |
| 2015 | de novo genome assembly of the South American freshwater fish Tambaqui (Colossoma macropomum). | LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
| 2012 | Development of a computational pipeline to detect positive selection. | CINTRA, L. C.; HONGO, J. A.; LOBO, F. P. |
| 2013 | Embrapa Bioinformatic Multi-user laboratory. | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; SILVA, F. R. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. |
| 2012 | Embrapa Bioinformatics Multi-Users Laboratory - LMB. | KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, F. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; HIGA, R.; VIEIRA, F. |
| 2019 | Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). | CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2019 | Genome sequencing and de novo assembly of tambaqui (Colossoma macropomum). | CAETANO, A. R.; IANELLA, P.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2019 | Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. | ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R. |
| 2019 | Genome sequencing and de novo assembly of the South American tiger catfish (Pseudoplatystoma Punctifer) using 10X sequencing data. | ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; YAMAGISHI, M. E. B.; VARELA, E. S.; PAIVA, S. R.; IANELLA, P.; CAETANO, A. R. |
| 2016 | Genome Sequencing and de novo assembly of the South American Tiger Catfish (Pseudoplatystoma punctifer). | LOBO, F. P.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; ALVES, A. L.; SILVA, N. M. A. da; IANELLA, P.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
| 2016 | Genome-wide copy number variation (CNV) detection in Nelore cattle reveals highly frequent variants in genome regions harboring QTLs affecting production traits. | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. |
| 2015 | Genomic variant hotspots in nelore cattle revealed by missing genotypes. | GIACHETTO, P. F.; SILVA, J. M. da; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2015 | Genomic Variants Revealed by Invariably Missing Genotypes in Nelore Cattle. | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2015 | Genomic variants revealed by invariably missing genotypes in nelore cattle. | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; CINTRA, L. C.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2022 | Gestão de dados de pesquisa no Laboratório Multiusuário de Bioinformática da Embrapa. | TORRES, T. Z.; VISOLI, M. C.; FALCAO, P. R. K.; SOUZA, M. I. F.; GIACHETTO, P. F.; NHANI JUNIOR, A.; CINTRA, L. C.; CUNHA, L. M. S.; BARBOSA, L. A. F. |
| 2014 | Métodos, procedimentos e técnicas utilizadas na construção de AgroTIC. | CINTRA, L. C.; NAKAI, A. M.; CORREA, J. L. |
| 2013 | Next generation sequencing and de novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome. | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI NETO, A.; LOBO, F. P.; GIACHETTO, P. F.; FALCAO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. |
| 2022 | Phylogenomic and expression analysis of Colossoma macropomum cyp19a1a and cyp19a1b and their non-classical role in tambaqui sex differentiation. | PAIXÃO, R. V.; SILVA, G. F. da; CAETANO, A. R.; CINTRA, L. C.; VARELA, E. S.; O'SULLIVAN, F. L. A. |
| 2015 | POTION: an end-to-end pipeline for positive Darwinian selection detection in genome-scale data through phylogenetic comparison of protein-coding genes. | HONGO, J. A.; CASTRO, G. M. de; CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P. |
