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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2022 | Caracterização do cluster gênico biossintético para produção do sideróforo petrobactina por Bacillus cereus SOL 105 isolado de sedimentos do Rio Solimões. | COSTA, G. V. da  ; SOUSA, T. F.; QUEIROZ, C. A.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da |
| 2023 | Characterization of peptaibols produced by a marine strain of the fungus Trichoderma endophyticum via Mass Spectrometry, genome mining and phylogeny-based prediction. | CASTRO, G. S.; SOUZA, T. F.; SILVA, G. F. da; PEDROSO, R. C. N.; MENEZES, K. S.; SOARES, M. A.; DIAS, G. M.; SANTOS, A. O.; YAMAGISHI, M. E. B.; FARIA, J. V.; JANUÁRIO, A. H.; KOOLEN, H. H. F. |
| 2013 | Chargaff's "Grammar of Biology": new fractal-like rules. | YAMAGISHI, M. E. B.; HERAI, R. H. |
| 2010 | CNBi: the new Brazilian National Consortium for Bioinformatics. | HERAI, R. H.; VIDAL, R. O.; CARAZZOLLE, M. F.; COSTA, G. G. L.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; FRANCHINI, K. G.; PEREIRA, G. G. A. |
| 2011 | Comparative transcriptome analyses of Fusarium oysporum f. sp. cubense. | DITA, M.; HERAI, R.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da; SOUZA JUNIOR, M. T.; GIACHETTO, P. F.; WAALWIJK, C.; KEMA, G. |
| 2011 | Comparative transcriptome analysis and genome assembly of Fusarium oxysporum f. sp. cubense. | RODRIGUEZ, M. A. D.; HERAI, R.; WAALWIJK, C.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; FERREIRA, G.; SOUZA JUNIOR, M. T.; KEMA, G. H. J. |
| 2012 | Comparative transcriptome analysis of eucalyptus genotypes that differ in carbon allocation. | GERHARDT, I. R.; GIACHETTO, P. F.; YAMAGISHI, M. E. B.; LOBO, F. P.; TEIXEIRA, J.; PENCHEL, R. M.; MISSIAGGIA, A. |
| 2017 | Complete mitochondrial genome from South American catfish Pseudoplatystoma reticulatum (Eigenmann & Eigenmann) and its impact in Siluriformes phylogenetic tree. | VILLELA, L. C. V.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; SILVA, N. M. A. da; PONZETTO, J. M.; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R. |
| 2012 | ConvolutionTR: comprehensive study of SNPs within tandem repeats. | NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCAO, P. R. |
| 2012 | ConvolutionTR: comprehensive study of SNPs within tandem repeats. | NARCISO, M. G.; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCAO, P. R. |
| 2023 | Could genes allocated to SH3 loci contribute to other resistance factors? | ANGELO, P. C. da S.; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, A. G.; PONCE, T. P.; ARIYOSHI, C.; SHIGUEOKA, L. H.; ARANTES, T.; GASPARINI, A. K.; SERA, G. H.; PEREIRA, L. F. P.; CAIXETA, E. T. |
| 2014 | De novo assembly of a Nelore (Bos indicus) bull genome based on short read sequences. | CINTRA, L. C.; ZERLOTINI, A.; LOBO, F. P.; SILVA, F. R. da; GIACHETTO, P. F.; KUSER-FALCÃO, P. R. K.; SILVA, L. O. C. da; EGITO, A. A. do; SIQUEIRA, F.; SILVA, N. M. A. da; PAIVA, S. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; CAETANO, A. R. |
| 2014 | Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. | CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. |
| 2014 | Desenvolvimento de ferramentas genômicas para manejo e melhoramento genético de peixes nativos do Brasil. | CAETANO, A. R.; ALVES, A. L.; VARELA, E. S.; VILLELA, L. C. V.; SILVA, N. M. A. da; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P. F.; HIGA, R. H.; PAIVA, S. R. |
| 2010 | Detecção de erros de montagens em regiões gênicas. | HERAI, R. H.; GIACHETTO, P. F.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. |
| 2014 | Detection of copy number variations in nelore beef cattle with high-density SNP genotyping data. | SILVA, J. M. da; GIACHETTO, P. F.; SILVA, L. O. C. da; PAIVA, S. R.; CAETANO, A. R.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2010 | Detection of human interchromosomal trans-splicing in sequence databanks. | HERAI, R. H.; YAMAGISHI, M. E. B. |
| 2016 | Detection of potential genetic variants affecting gene function in Guzerat cattle. | ZERLOTINI NETO, A.; STAFUZZA, N. B.; LOBO, F. P.; YAMAGISHI, M. E. B.; CHUD, T. C. S.; CAETANO, A. R.; MUNARI, D. P.; GARRICK, D. J.; MACHADO, M. A.; MARTINS, M. F.; CARVALHO, M. R.; SILVA, M. V. G. B. |
| 2020 | Differential expression and structural polymorphism in rubber tree genes related to South American leaf blight resistance. | ANGELO, P. C. da S.; YAMAGISHI, M. E. B.; CRUZ, J. C. da; SILVA, G. F. da; GASPAROTTO, L. |
| 2022 | Diversidade de clusters gênicos biossintéticos em Streptomyces sp. MAD39, isolado com potencial para biocontrole de patógenos de cadeias agrícolas regionais. | CAMPOS, C. C. B.; SOUSA, T. F.; SILVA, I. J. da; YAMAGISHI, M. E. B.; SILVA, G. F. da |
