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| Issue Date | Title | Author(s) |
| 2006 | 2D maps of protein surface. | NARCISO, M. G.  ; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. |
| 2020 | A comparison between internal protein nanoenvironments of alfa-helices and beta-sheets. | MAZONI, I.; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; NESHICH, G. |
| 2006 | A fast surface-matching procedure for protein-ligand docking. | YAMAGISHI, M. E. B.; MARTINS, N. F.; NESHICH, G.; CAI, W.; SHAO, X.; BEAUTRAIT, A.; MAIGRET, B. |
| 2006 | An integrated database of structural parameters for protein analysis. | OLIVEIRA, S. R. de M.; ALMEIDA, G. V.; SOUZA, K. R. R.; RODRIGUES, D. N.; NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G. |
| 2006 | Analysing protein-protein interface using JPIV. | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. de M.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; NESHICH, G. |
| 2010 | Analysis of binding properties and specificity through identification of the interface forming residues (IFR) for serine proteases in silico docked to different inhibitors. | RIBEIRO, C.; TOGAWA, R. C.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; MINARDI, R. C. de M.; SILVEIRA, C. H. da; JARDINE, J. G.; SANTORO, M. M.; NESHICH, G. |
| 2016 | Binding affinity prediction using a nonparametric regression model based on physicochemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. | BORRO, L.; YANO, I. H.; MAZONI, I.; NESHICH, G. |
| 2014 | Biologia computacional molecular e suas aplicações na agricultura. | JARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; BORRO, L.; NISHIMURA, L. S.; NESHICH, G. |
| 2006 | BlueStar STING - a multiplatform environment for protein structure analysis. | KUSER, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; BORRO, L. C.; NESHICH, G. |
| 2012 | BlueStar STING platform for analysis of protein structure / function relationship: designing agrochemicals to fit new protein targets for bacterial, fungal and insect control. | NESHICH, G. |
| 2006 | Building multiple sequence alignments with a flavor of HSSP alignments. | HIGA, R. H.; CRUZ, S. A. B. da; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; FILETO, R.; OLIVEIRA, S. R. de M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; MANCINI, A. L.; NESHICH, G. |
| 2008 | "Cloud computation" na forma de serviços WEB para um banco de dados federativo STING_RDB. | NESHICH, G.; JARDINE, J. G.; BERNARDES, R.; MAZONI, I.; MANCINI, A. L.; SILVEIRA, C. da |
| 2006 | Comparisson of the amino acids co-evolution and the correlated structure descriptors. | MAZONI, I.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M.; BORRO, L.; JARDINE, J. G.; SANTOS, E. H. dos; OLIVEIRA, S. R. de M.; NESHICH, G.; NARCISO, M. G. |
| 2007 | Computational biology in Brazil. | NESHICH, G. |
| 2015 | Computational Biology tools in design of an agrochemical against Xylella fastidiosa. | FULAZ, S. F.; CABRINI, F. M.; BORRO, L.; TASIC, L.; NESHICH, G. |
| 2015 | Computational biology tools in design of an agrochemical against Xyllela fastidiosa. | FULAZ, S. F.; CABRINI, F.; TASIC, L.; BORRO, L.; NESHICH, G. |
| 2006 | Contacts as the key elements for comparing two protein structures. | MELO, R. C.; MAZONI, I.; NESHICH, G.; SANTORO, M. M.; MEIRA JÚNIOR, W. |
| 2020 | DPIN: um dicionário dos nanoambientes internos das proteínas e seu potencial para transformação em ativos para a agricultura. | MAZONI, I.; NESHICH, G. |
| 2006 | Dynamics of catalysis and inhibition in oligopeptidases: natural peptide structures as promising antihypertensive agents. | FERNANDEZ, J. H.; RIOLI, V.; NESHICH, G.; FERRO, E. S.; PORTARO, F. C.; CAMARGO, A. C. M. |
| 2008 | Electrostatic potential at the alpha carbon atoms along the alpha helices and beta strands. | MAZONI, I.; JARDINE, J. G.; BORRO, L. C.; ALVARENGA, D.; NESHICH, G. |
