| Issue Date | Title | Author(s) |
| 2020 | A comparison between internal protein nanoenvironments of α-helices and beta-sheets. | MAZONI, I.  ; SALIM, J. A.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; NESHICH, G. |
| 2014 | Biologia computacional molecular e suas aplicações na agricultura. | JARDINE, J. G.; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; MORAES, F. R. de; SALIM, J. A.; BORRO, L.; NISHIMURA, L. S.; NESHICH, G. |
| 2022 | Data standardization of plant-pollinator interactions. | SALIM, J. A.; SARAIVA, A. M.; ZERMOGLIO, P. F.; AGOSTINI, K.; WOLOWSKI, M.; DRUCKER, D. P.; SOARES, F. M.; BERGAMO, P. J.; VARASSIN, I. G.; FREITAS, L.; MAUES, M. M.; RECH, A. R.; VEIGA, A. K.; ACOSTA, A. L.; ARAUJO, A. C.; NOGUEIRA, A.; BLOCHTEIN, B.; FREITAS, B. M.; ALBERTINI, B. C.; MAIA-SILVA, C.; NUNES, C. E. P.; PIRES, C. S. S.; SANTOS, C. F. dos; QUEIROZ, E. P.; CARTOLANO, E. A.; OLIVEIRA, F. F. de; AMORIM, F. W.; FONTÚRBEL, F. E.; SILVA, G. V. da; CONSOLARO, H.; ALVES-DOS-SANTOS, I.; MACHADO, I. C.; SILVA, J. S.; ALEIXO, K. P.; CARVALHEIRO, L. G.; ROCCA, M. A.; PINHEIRO, M.; HRNCIR, M.; STREHER, N. S.; FERREIRA, P. A.; ALBUQUERQUE, P. M. C. de; MARUYAMA, P. K.; BORGES, R. C.; GIANNINI, T. C.; BRITO, V. L. G. |
| 2023 | Flower-Insect Timed Counts (FIT Count): protocol adaptation and preliminary results in Brazil. | SOARES, F. M.; KOFFLER, S.; GHILARDI-LOPES, P. N.; CARVELL, C.; CHIAZZESE, J.; DRUCKER, D. P.; SALIM, J. A.; ALBERTINI, B. de C.; NUNES-SILVA, P.; SARAIVA, A. M. |
| 2015 | Improving binding affinity prediction by using a rule-based model with physical-chemical and structural descriptors of the nano-environment for protein-ligand interactions. | BORRO, L. C.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; YANO, I.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. |
| 2014 | Improving predictions of protein-protein interfaces by combining amino acid-specific classifiers based on structural and physicochemical descriptors with their weighted neighbor averages. | MORAES, F. R. de; NESHICH, I. A. P.; MAZONI, I.; YANO, I. H.; PEREIRA, J. G. C.; SALIM, J. A.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. |
| 2025 | Incorporating measures of data quality into plant-pollinator databases. | OLLERTON, J.; TALIGA, C.; SALIM, J. A.; POELEN, J. H.; DRUCKER, D. P. |
| 2025 | Learning to utilize internal protein 3D nanoenvironment descriptors in predicting CRISPR–Cas9 of f-tar get activity. | MAK, J. K.; BENDANDI, A.; SALIM, J. A.; MAZONI, I.; MORAES, F. R. de; BORRO, L.; STÖRTZ, F.; ROCCHIA, W.; NESHICH, G.; MINARY, P. |
| 2018 | Study of specific nanoenvironments containing α-helices in all-α and ([α]+[β])+([α]/[β]) proteins. | MAZONI, I.; BORRO, L. C.; JARDINE, J. G.; YANO, I. H.; SALIM, J. A.; NESHICH, G. |
