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Campo DCValorIdioma
dc.contributor.authorSHIRAKAWA, K. T.pt_BR
dc.contributor.authorCHIARI, L.pt_BR
dc.contributor.authorPEREIRA, R. M.pt_BR
dc.date.accessioned2015-03-24T11:11:11Zpt_BR
dc.date.available2015-03-24T11:11:11Zpt_BR
dc.date.created2015-03-24pt_BR
dc.date.issued2014pt_BR
dc.identifier.citationIN: ENCONTRO DE ENSINO, PESQUISA E EXTENSÃO; ENEPE UFGD, 8.; EPEX UEMS, 5., 2014. Dourados.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1012042pt_BR
dc.descriptionO capim-braquiária é muito utilizado no Brasil, principalmente no cerrado, como forrageira devido a sua alta adaptabilidade a variados solos, como solos ácidos ou pobres em nutrientes; e apresenta alta cobertura e produção de biomassa. Os peptídeos antimicrobianos são moléculas proteicas pequenas produzidas por todos os seres vivos como parte do sistema imune inato para combater infecções e patógenos. Peptídeos antimicrobianos vegetais possuem um amplo espectro de atividades antimicrobianas contra fitopatógenos e a grande maioria deles é ativa contra fungos, enquanto alguns são inibidores de bactérias e insetos herbívoros. Deste modo, o objetivo deste trabalho foi verificar e identificar a presença de peptídeos antimicrobianos da família das defensinas em U. decumbens por meio da comparação entre as sequências do transcriptoma da planta contra as sequências de aminoácidos de peptídeos antimicrobianos. O transcriptoma da planta foi fornecido pela EMBRAPA Gado de Corte (Campo Grande, MS), obtido pela extração de RNA de plantas expostas a condições de estresse (com alumínio) e sem estresse (sem alumínio). As sequências dos peptídeos antimicrobianos foram baixadas do banco de dados online CAMP e foram formatadas em FASTA em um banco local no computador da FCBA, UFGD. Foi utilizado o blast local para fazer o alinhamento entre os 164.920 transcritos únicos da U. decumbens e as 5.906 sequências de peptídeos antimicrobianos. Deste alinhamento obteve-se 3.161 similaridades com 251 peptídeos diferentes. Para a análise dos resultados utilizou-se o MySQL, separando-os em famílias de acordo com a classificação do banco de dados CAMP e selecionando um grupo amostral para a construção das árvores filogenéticas. A partir desta análise, obteve-se 261 similaridades com 52 peptídeos diferentes dentro da família das defensinas. A maioria dos peptídeos antimicrobianos identificados possui atividade antifúngica ou antimicrobiana, e são de origem vegetal o que condiz com os transcritos da gramínea.pt_BR
dc.language.isoporpt_BR
dc.rightsopenAccesspt_BR
dc.subjectTranscriptomapt_BR
dc.subjectAMPspt_BR
dc.titleFamília defensiva de peptídeos antimicrobianos em Urochloa.pt_BR
dc.typeArtigo em anais e proceedingspt_BR
dc.date.updated2017-03-27T11:11:11Zpt_BR
dc.subject.thesagroGramíneapt_BR
riaa.ainfo.id1012042pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate2017-03-27pt_BR
dc.contributor.institutionKARINA TAMIE SHIRAKAWA, PIBIC/UFGD/CNPq; LUCIMARA CHIARI, CNPGC; RODRIGO MATHEUS PEREIRA, UFGD.pt_BR
Aparece nas coleções:Artigo em anais de congresso (CNPGC)

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