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Campo DCValorLengua/Idioma
dc.contributor.authorPEZENTI, L. F.pt_BR
dc.contributor.authorGONÇALVES, K. B.pt_BR
dc.contributor.authorSOUZA, R. F.pt_BR
dc.contributor.authorVILAS-BOAS, L. A.pt_BR
dc.contributor.authorSOSA-GOMEZ, D. R.pt_BR
dc.contributor.authorROSA, R. dapt_BR
dc.date.accessioned2016-12-27T11:11:11Zpt_BR
dc.date.available2016-12-27T11:11:11Zpt_BR
dc.date.created2016-12-27pt_BR
dc.date.issued2016pt_BR
dc.identifier.citationIn: ENCONTRO PARANAENSE DE GENÉTICA, 13., GENÉTICA NAS FÉRIAS, 10., 2016. Tempos modernos: anais. Londrina: UEL, 2016.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1059312pt_BR
dc.descriptionAnticarsia gemmatalis Hübner 1818 (Lepidoptera: Noctuidae), conhecida como lagarta-da-soja é a desfolhadora mais comum da soja no Brasil, ocasionando perdas consideráveis na produtividade da cultura. Informações relevantes têm sido obtidas a respeito das bases genéticas e fisiológicas associadas à resistência de insetos a vários tipos de inseticidas, através da aplicação de técnicas moleculares para determinar padrões de expressão gênica. Entre elas, destaca-se o RNA-seq que permite quantificar o nível de expressão gênica, além de analisar a estrutura do transcriptoma sem a necessidade de um conhecimento prévio do genoma estudado. Dessa maneira, neste trabalho foram obtidos os transcritos de diferentes populações de A. gemmatalis (resistentes e suscetíveis, tratadas e não-tratadas com a proteína bioinseticida de Bacillus thuringiensis - Cry1Ac), e analisados o seu perfil transcricional através do RNA-seq. Foram construídas doze bibliotecas de cDNA (protocolo Illumina TruSeq Stranded mRNA LS) a partir de doze amostras de RNA extraídas conforme protocolo adaptado utilizando TRIzol® Reagent e o SV Total RNA Isolation System Promega. O sequenciamento foi realizado na plataforma Illumina HiSeq 2500 V4 com leitura paired-end de 125pb. A qualidade dos reads obtidos foram verificados com FastQC v0.11.4, e trimados com Prinseq v0.20.4. A montagem do transcriptoma foi realizada na plataforma Trinity v2.2.0 com a estratégia de novo, pois não existe um genoma de referência para o mapeamento dos transcritos e construção de contigs. Os transcritos de uma das bibliotecas foram anotados e categorizados usando o software Blast2go v3.2.7, logo após a busca por similaridade dos transcritos contra banco de dados. O transcriptoma das doze bibliotecas de A. gemmatalis apresentou 754.280 transcritos, montados a partir de 503.590.692 reads, com uma média de 41.965.891 milhões de reads por biblioteca, e N50 variando de 1146 a 1520. Os dados apresentados são preliminares, porém este estudo nos permite reportar a montagem do transcriptoma de A. gemmatalis e apresentar dados preliminares de anotação funcional. Estes resultados abrem novas perspectivas para o estudo genômico de A. gemmatalis, e possibilitará a posterior identificação de genes candidatos relacionados aos mecanismos de resistência de importantes pragas agrícolas.pt_BR
dc.language.isoporpt_BR
dc.rightsopenAccesspt_BR
dc.subjectLagarta-da-sojapt_BR
dc.subjectTranscriptomapt_BR
dc.titleMontagem de novo do transcriptoma de Anticarsia gemmatalis.pt_BR
dc.typeResumo em anais e proceedingspt_BR
dc.date.updated2019-06-07T11:11:11Zpt_BR
dc.subject.thesagroGenéticapt_BR
dc.subject.thesagroRNApt_BR
dc.format.extent2p. 43.pt_BR
riaa.ainfo.id1059312pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate2019-06-07 -03:00:00pt_BR
dc.contributor.institutionDANIEL RICARDO SOSA GOMEZ, CNPSO.pt_BR
Aparece en las colecciones:Resumo em anais de congresso (CNPSO)

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