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dc.contributor.authorFAJARDO, T. V. M.pt_BR
dc.contributor.authorVANNI, M. F.pt_BR
dc.contributor.authorNICKEL, O.pt_BR
dc.date.accessioned2017-05-08T11:11:11Zpt_BR
dc.date.available2017-05-08T11:11:11Zpt_BR
dc.date.created2017-05-08pt_BR
dc.date.issued2017pt_BR
dc.identifier.citationCiência Rural, Santa Maria, v. 47, n. 6, e20161063, 2017.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1069291pt_BR
dc.descriptionThe absolute quantification determines the absolute amount of a targeted nucleic acid expressed as a copy number or concentration. The knowledge of virus concentrations in commercial crops possesses high relevance to ensure a reliable diagnosis. The objective of this study was to perform an absolute quantification of five viruses in infected grapevines (Vitis spp.). Different known amounts of the standard sample (cloned viral cDNA or in vitro transcribed viral RNA) were quantified by TaqMan RT-qPCR. Based on these data, standard curves were generated plotting Ct values (threshold cycle) against the log of the standard sample amount. Infected grapevine samples were evaluated to determine virus titers, which were highly variable. This result may contribute to improve virus diagnosis by accurately quantifying virus titre variations in grapevines. Key words: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 and -4. RESUMO: A quantificação absoluta determina a quantidade absoluta de um ácido nucleico alvo expressa como número de cópias ou concentração. O conhecimento das concentrações virais em culturas comerciais tem grande relevância para assegurar um diagnóstico confiável. O objetivo deste trabalho foi realizar uma quantificação absoluta de cinco vírus em videiras infectadas (Vitis spp.). Diferentes quantidades conhecidas da amostra padrão (cDNA viral clonado ou RNA viral transcrito in vitro) foram quantificadas por RT-qPCR TaqMan. A partir destes dados, curvas padrão foram geradas plotando-se os valores de Ct (ciclo limiar) contra o log da quantidade da amostra padrão. Amostras de videiras infectadas foram avaliadas visando-se determinar os títulos virais que foram bastante variáveis. Este resultado contribui para melhorar o diagnóstico viral ao quantificar com precisão variações no título viral em videiras. Palavras-chave: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 e -4. A quantificação absoluta determina a quantidade absoluta de um ácido nucleico alvo expressa como número de cópias ou concentração. O conhecimento das concentrações virais em culturas comerciais tem grande relevância para assegurar um diagnóstico confiável. O objetivo deste trabalho foi realizar uma quantificação absoluta de cinco vírus em videiras infectadas (Vitis spp.). Diferentes quantidades conhecidas da amostra padrão (cDNA viral clonado ou RNA viral transcrito in vitro) foram quantificadas por RT-qPCR TaqMan. A partir destes dados, curvas padrão foram geradas plotando-se os valores de Ct (ciclo limiar) contra o log da quantidade da amostra padrão. Amostras de videiras infectadas foram avaliadas visando-se determinar os títulos virais que foram bastante variáveis. Este resultado contribui para melhorar o diagnóstico viral ao quantificar com precisão variações no título viral em videiras. Palavras-chave: RT-qPCR, GRSPaV, GVA, GVD, GLRaV-3 e -4.pt_BR
dc.language.isoengpt_BR
dc.rightsopenAccesseng
dc.subjectRT-qPCRpt_BR
dc.subjectGRSPaVpt_BR
dc.subjectGVApt_BR
dc.subjectGVDpt_BR
dc.subjectGLRaV-3pt_BR
dc.subjectVideirapt_BR
dc.titleAbsolute quantification of viruses by TaqMan real-time RT-PCR in grapevines.pt_BR
dc.typeArtigo de periódicopt_BR
dc.date.updated2019-05-06T11:11:11Zpt_BR
dc.subject.thesagroUvapt_BR
dc.subject.thesagroViruspt_BR
riaa.ainfo.id1069291pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate2019-05-06 -03:00:00pt_BR
dc.contributor.institutionTHOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; MARCOS FERNANDO VANNI, CNPUV; OSMAR NICKEL, CNPUV.pt_BR
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