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dc.contributor.authorVIEIRA, F. D.
dc.contributor.authorMOURA, D. G. de
dc.contributor.authorSILVA, D. F.
dc.contributor.authorHIGA, R. H.
dc.contributor.authorZERLOTINI NETO, A.
dc.date.accessioned2017-12-23T23:28:59Z-
dc.date.available2017-12-23T23:28:59Z-
dc.date.created2017-12-22
dc.date.issued2017
dc.identifier.citationIn: CONGRESSO BRASILEIRO DE AGROINFORMÁTICA, 11., 2017, Campinas. Ciência de dados na era da agricultura digital: anais. Campinas: Editora da Unicamp: Embrapa Informática Agropecuária, 2017.
dc.identifier.isbn978-85-85783-75-4
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1083373-
dc.descriptionNos últimos anos, o uso de genotipagem em grande escala de dezenas ou centenas de milhares de polimorfismos de nucleotídeo único (SNP) para estimar o perfil genômico de animais permitiu o desenvolvimento de estudos de associação genótipo-fenótipo em escala genômica (GWAS) e a introdução da tecnologia de seleção genômica em programas de melhoramento genético. No entanto, esta situação implica na necessidade de armazenamento de grande volume de dados de genotipagem, fenotipagem e pedigree de um elevado número de animais. Para integrar esse volume de dados distintos, é primordial utilizar uma estrutura de armazenamento robusta, como um SGBD. Assim, uma questão importante a considerar é o equilíbrio entre normalização e desempenho durante o estágio de modelagem de banco de dados, pois isso terá um impacto direto na usabilidade e na experiência do usuário. Buscando resolver esse problema de armazenamento eficiente e consultas rápidas num grande volume de dados, este trabalho apresenta o sistema BDGF (Banco de Dados de Genótipos e Fenótipos). Seu modelo de dados permite a implementação do tipo JSON em campos de tabelas relacionadas a fenótipos e do tipo texto em campos da tabela genótipos. BDGF foi projetado para dar suporte a projetos de criação de animais da Embrapa, mas pode ser facilmente ajustado para armazenar dados de diversas fontes, tais como dados de plantas. Além disso, o sistema implementa políticas de acesso e segurança para fenótipos, genótipos e pedigree dos animais.
dc.language.isoporpt_BR
dc.rightsopenAccesspt_BR
dc.subjectTecnologias Java EE
dc.subjectSistema Gerenciador de Banco de Dados
dc.subjectPostgreSQL
dc.subjectJavaScript Object Notation
dc.subjectJSON
dc.subjectPolimorfismo de nucleotídeo único
dc.subjectBanco de Dados de Genótipos e Fenótipos
dc.titleBDGF: um sistema web para recuperação de informação de genótipos e fenótipos.
dc.typeArtigo em anais e proceedings
dc.date.updated2020-01-21T11:11:11Zpt_BR
dc.subject.nalthesaurusDatabases
dc.subject.nalthesaurusSingle nucleotide polymorphism
dc.subject.nalthesaurusGenotype
dc.subject.nalthesaurusPhenotype
dc.description.notesSBIAgro 2017. Na publicação: Adhemar Zerlotini.
dc.format.extent2p. 429-438.
riaa.ainfo.id1083373
riaa.ainfo.lastupdate2020-01-21 -02:00:00
dc.contributor.institutionFABIO DANILO VIEIRA, CNPTIA; DANILO GOMES DE MOURA; DIEGO FÉLIX DA SILVA, Programa Geneplus-Embrapa; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; ADHEMAR ZERLOTINI NETO, CNPTIA.
Aparece nas coleções:Artigo em anais de congresso (CNPTIA)

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