Use este identificador para citar ou linkar para este item: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1109931
Título: Wavelet-domain elastic net for clustering on genomes strains.
Autoria: FERREIRA, L. M.
SÁFADI, T.
FERREIRA, J. L.
Afiliação: Leila Maria Ferreira, UFLA; Thelma Sáfadi, UFLA; JULIANO LINO FERREIRA, CPPSUL.
Ano de publicação: 2018
Referência: Genetics and Molecular Biology, v. 41, n. 4, p. 884-892, Oct./Dec. 2018.
Conteúdo: We propose to evaluate genome similarity by combining discrete non-decimated wavelet transform (NDWT) and elastic net. The wavelets represent a signal with levels of detail, that is, hidden components are detected by means of the decomposition of this signal, where each level provides a different characteristic. The main feature of the elastic net is the grouping of correlated variables where the number of predictors is greater than the number of observations. The combination of these two methodologies applied in the clustering analysis of the Mycobacterium tuberculosis genome strains proved very effective, being able to identify clusters at each level of decomposition.
Thesagro: Genoma
Micobactéria
Bactéria Patogênica
Linhagem
Genética
Análise Estatística
Tipo do material: Artigo de periódico
Acesso: openAccess
Aparece nas coleções:Artigo em periódico indexado (CPPSUL)

Arquivos associados a este item:
Arquivo Descrição TamanhoFormato 
GMB201800351.pdf2,36 MBAdobe PDFThumbnail
Visualizar/Abrir

FacebookTwitterDeliciousLinkedInGoogle BookmarksMySpace