Título:	Validação de retrotransposons ativos em café-efeitos de estresse abiótico e baixa cafeína na expressão gênica.
Autor:	GUIMARÃES, P. de S. SCHENK, J. C. M. GIACHETTO, P. F. PADILHA, L. SILVAROLLA, M. B. MALUF, M. P.
Afiliación:	PAULA DE SOUSA GUIMARÃES, Bolsista do Consórcio Pesquisa Café; JULIANA CAMARGO MARTINATI SCHENK, IAC, Bolsista INCT/CNPq; POLIANA FERNANDA GIACHETTO, CNPTIA; LILIAN PADILHA, CNPCa; MARIA BERNADETE SILVAROLLA, IAC; MIRIAN PEREZ MALUF, CNPCa.
Año:	2019
Referencia:	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 10., 2019, Vitória, ES. Pesquisa, inovação e sustentabilidade dos cafés do Brasil. Brasília, DF: Embrapa Café, 2019.
Páginas:	4 p.
Descripción:	RESUMO: A identificação de perfis de expressão gênica diferenciais e redes metabólicas é uma ferramenta valiosa para a caracterização genética de caracteres agronômicos. Neste estudo, utilizamos análises de expressão em larga-escala para identificar processos biológicos alterados em plantas com teores reduzidos de cafeína. A expressão diferencial de genes selecionados observada in silico foi então validada em experimentos in vivo. O primeiro passo foi o sequenciamento em larga-escala de RNA extraído de tecidos jovens e em desenvolvimento, de plantas sem cafeína e de plantas com concentrações normais do composto. As sequências obtidas foram agrupadas, a partir de análises in silico, para identificação de genes com expressão diferencial entre os tratamentos e de redes metabólicas associadas aos teores de cafeína. Para a validação das análises in silico, selecionamos 3 genes de famílias de retrotransposons para análises de qRT-PCR em gemas e folhas coletadas de plantas normais (MN) e sem cafeína (AC), tanto em condições normais quanto durante déficit hídrico. O perfil de expressão dos genes estabelecido por qRT-PCR foi distinto do observado nas análises de RNAseq. Além disso, os resultados sugerem que plantas AC possuem uma maior suscetibilidade ao estresse hídrico, uma vez que a expressão de retrotransposons é mais alta em folhas e gemas de plantas AC do que em MN.
NAL Thesaurus:	Gene expression
Palabras clave:	Seleção-assistida Melhoramento molecular Sequenciamento de RNA Expressão gênica Plantas sem cafeína Assisted-selection Sequenciamento de transcriptoma RNAseq Molecular breeding
Notas:	Título em inglês: Validation of active retrotransposons in coffee-effects of abiotic stress and low caffeine content on gene expression.
Tipo de Material:	Artigo em anais e proceedings
Acceso:	openAccess
Aparece en las colecciones:	Artigo em anais de congresso (CNPTIA)