Análise das curvas de dissociação de alta resolução de RT-PCR em tempo real para detectar e diferenciar variantes brasileiras de vírus da videira.

FAJARDO, T. V. M.; PERES, C. A.; NICKEL, O.

Please use this identifier to cite or link to this item: http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1159852

Full metadata record

DC Field	Value	Language
dc.contributor.author	FAJARDO, T. V. M.
dc.contributor.author	PERES, C. A.
dc.contributor.author	NICKEL, O.
dc.date.accessioned	2023-12-18T13:32:39Z	-
dc.date.available	2023-12-18T13:32:39Z	-
dc.date.created	2023-12-18
dc.date.issued	2023
dc.identifier.citation	Ciência e Técnica Vitivinícola, v. 38, n. 2, p. 188-195, 2023.
dc.identifier.uri	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1159852	-
dc.description	Detectar e identificar infecções virais em plantas perenes, como videiras, pode ser um desafio. Portanto, o objetivo deste estudo foi realizar uma análise da curva de dissociação de alta resolução (HRM) por RT-PCR em tempo real (RT-qPCR) para detectar e diferenciar variantes do vírus do enrolamento foliar tipo 3 (GLRaV-3) e do vírus do urticado ou nó-curto (GFLV) em 74 e 10 plantas infetadas, respectivamente, mantidas em blocos de coleções de videiras. Uma única curva de amplificação foi gerada para cada amostra por RT-qPCR. Considerando a região amplificada dos genomas dos dois vírus, foi possível identificar diferentes variantes de GLRaV-3 e GFLV, que apresentaram valores de temperatura de dissociação (Tm) significamente diferentes entre si, refletindo diferenças nas sequências de nucleotídeos dos respectivos DNA amplificados e, assim, constituindo uma forma simplificada de diferenciar variantes e avaliar a diversidade viral em acessos de videiras. A análise de HRM foi validada pelo sequenciamento e comparação de nucleotídeos de isolados brasileiros de GLRaV-3 e GFLV.
dc.language.iso	por
dc.rights	openAccess
dc.subject	GLRaV-3
dc.subject	GFLV
dc.subject	HRM
dc.subject	RT-qPCR
dc.subject	Variantes de sequência
dc.subject	Sequence variants
dc.title	Análise das curvas de dissociação de alta resolução de RT-PCR em tempo real para detectar e diferenciar variantes brasileiras de vírus da videira.
dc.type	Artigo de periódico
riaa.ainfo.id	1159852
riaa.ainfo.lastupdate	2023-12-18
dc.identifier.doi	https://doi.org/10.1051/ctv/ctv20233802188
dc.contributor.institution	THOR VINICIUS MARTINS FAJARDO, CNPUV; CAIO ANTONIETTE PERES, UNIVERSIDADE ESTADUAL DO RIO GRANDE DO SUL; OSMAR NICKEL, CNPUV.
Appears in Collections:	Artigo em periódico indexado (CNPUV)

Files in This Item:

File	Description	Size	Format
Fajardo-CiencTecVit-V-38-n2-p188-195-2023.pdf		356.39 kB	Adobe PDF	View/Open

Show simple item record