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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1170714Registro completo de metadatos
| Campo DC | Valor | Lengua/Idioma |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | SILVA, N. M. L. | |
| dc.date.accessioned | 2024-12-28T17:53:14Z | - |
| dc.date.available | 2024-12-28T17:53:14Z | - |
| dc.date.created | 2024-12-23 | |
| dc.date.issued | 2024 | |
| dc.identifier.citation | 2024. | |
| dc.identifier.uri | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1170714 | - |
| dc.description | O objetivo desta tese foi identificar o gene mestre determinante do sexo (MSD) do tambaqui e obter um teste molecular simples, de 100% de acurácia, para identificar o sexo genotípico da espécie. Foram identificados SNPs determinantes do sexo no tambaqui, e a região genômica em que esses marcadores moleculares foram encontrados foi investigada com o sequenciamento dos genes mestres candidatos. Os dados genotípicos de 192 amostras genotipadas com o chip de média densidade Axiom SerraSNP foram utilizados no presente estudo. A associação genômica ampla (GWAS) identificou cinco regiões genômicas associadas ao sexo no tambaqui. Os genótipos de todos os SNPs indicaram um sistema genético XX/XY. O grupo de ligação e a posição desses SNPs foram localizados no genoma referência do tambaqui (NCBI: GCF_904425465.1). Esses marcadores foram encontrados em íntrons dos genes znrf2b, zgc:158766 e LOC118799143 e em uma região próxima ao gene bHLH. Primers foram desenhados em íntrons e éxons dos genes znrf2b e bHLH e em éxons dos genes fzd1 e nod1, sendo que esses dois últimos genes estavam localizados próximos ao znrf2b. PCRs foram feitas com os primers utilizando um subconjunto de amostras de doze machos e doze fêmeas. Esse subconjunto é proveniente dos dados genotípicos das 192 amostras. Foi feita mais uma análise de GWAS com os SNPs recém-descobertos e com os marcadores do AxiomSerraSNP. Cinco SNPs recém-descobertos estavam associados ao sexo. Os marcadores que apresentaram maior acurácia estavam localizados nos íntrons do gene znrf2b e no éxon do nod1. O SNP encontrado no nod1 é responsável por uma variação no códon do RNAm (TGC e TGT), no entanto as duas trincas de bases codificam um mesmo aminoácido, que é a cisteína. Os primers desenhados no éxon do gene bHLH amplificaram o fragmento de DNA principalmente nos machos. Os resultados indicam que algum dos genes (znrf2b, bHLH, fzd1 ou nod1) pode ser o mestre da determinação do sexo em tambaqui, uma vez que não foi possível sequenciar todos os éxons desses genes devido à ausência de amplificação das sequências-alvo (dentre os 26 primers desenhados nos genes, somente 15 amplificaram o fragmento de DNA). Sendo assim, é necessário a realização de estudos complementares que explorem ainda mais essas regiões para compreender melhor os mecanismos de determinação e diferenciação do sexo em tambaqui. | |
| dc.language.iso | por | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | GWAS | |
| dc.subject | SNPs | |
| dc.subject | XX/XY | |
| dc.title | Análise genômica de regiões associadas a determinação do sexo em tambaqui (Colossoma macropomum). | |
| dc.type | Teses | |
| dc.subject.thesagro | Piscicultura | |
| dc.description.notes | Tese (Doutorado em Ciências Animais) - Faculdade de Agronomia e Medicina Veterinária da Universidade de Brasília, 2024 Orientadores: Alexandre Rodrigues Caetano e Patrícia Ianella, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia. | |
| riaa.ainfo.id | 1170714 | |
| riaa.ainfo.lastupdate | 2024-12-23 | |
| Aparece en las colecciones: | Tese/dissertação (CENARGEN)  | |
Ficheros en este ítem:
| Fichero | Descripción | Tamaño | Formato | |
|---|---|---|---|---|
| TESE-VERSAO-FINAL-NAYELLE.pdf | 5.36 MB | Adobe PDF |  Visualizar/Abrir |
