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dc.contributor.authorPEREIRA, M. P. M.
dc.date.accessioned2025-05-08T18:47:39Z-
dc.date.available2025-05-08T18:47:39Z-
dc.date.created2025-05-08
dc.date.issued2023
dc.identifier.citation2023.
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1175419-
dc.descriptionA região do Vale do São Francisco destaca-se como o maior polo nacional produtor de fruticultura irrigada, tendo como um dos destaques, o cultivo da videira. No entanto, o cancro bacteriano da videira causado pela bactéria X. citri pv. Viti cola (Xcv), tem afetado a produtividade e a qualidade da cultura. Assim, o objetivo deste trabalho foi identificar, caracterizar e analisar as fitoalexinas envolvidas no processo de defesa em videira infectada por X. citri para avaliação de seu potencial para o melhoramento genético ou biotecnologia da espécie. O experimento foi conduzido em casa de vegetação visando a geração de bibliotecas de RNA-Seq a partir de clones de videira da cultivar Red Globe (susceptível a Xcv) e do híbrido IAC-572 (moderadamente resistente a Xcv). As plantas foram inoculadas com uma suspensão bacteriana e tiveram seus tecidos foliares coletados após 90 minutos de inoculação com a bactéria. O RNA total foi extraído, purificado e enviado para a construção das bibliotecas de RNA-Seq e sequenciado. Foi realizada a identificação das sequências candidatas das famílias gênicas Estilbenes Sintases (STS) e Resveratrol O-metiltransferases (ROMT) e calculados o peso molecular (pM) e o ponto isoelétrico (pI), e realizada a localização subcelular. Os motivos conservados foram identificados pelo MEME-Suit e as localizações cromossômicas foram extraídas do Phytozome v13 e NCBI. Foi realizada a localização dos genes e identificação das estruturas gênicas de STS e ROMT. As proteínas caracterizadas foram submetidas a um alinhamento múltiplo pelo ClustalW e as árvores genéticas foram construídas no MEGA X. A maioria das sequências STS e ROMT apresentaram características ácidas, pM variável e localização subcelular predominante no citoplasma. Os dados de Ontologia Gênica das proteínas STS das duas espécies de videira apresentaram Processo Biológico (PB) relacionado aos processos biossintéticos, metabólicos, respostas a estímulos, resposta a estresses e defesa vegetal. A Função Molecular indicou a participação das proteínas em atividades de triidroxiestilbene sintase, transferase, acetiltransferase e catalítica. O fenograma demonstrou a formação de sete clusters para a família STS e três para ROMT. O heatmap gerado para os transcritos STS demonstrou a formação de dois clusters, sendo um para cada cultivar de videira estudada. Os dados de expressão in silico indicaram que o cluster do híbrido IAC-572 reuniu três transcritos STS reprimidos e um induzido, enquanto o cluster da cultivar Red Globe reuniu um transcrito induzido. Para ROMT foi observado a formação de dois clusters, sendo um para cada cultivar. No cluster do híbrido IAC-572 nenhum transcrito foi induzido e no cluster da Red Globe foram verificados dois transcritos induzidos. A inoculação com X. citri após 90 minutos de estresse resultam na indução de poucos transcritos das famílias de genes STS e ROMT no híbrido IAC-572, no entanto, fica evidente que as cultivares apresentam estratégias de defesa contrastantes frente ao estresse ocasionado pelo agente bacteriano.
dc.language.isopor
dc.rightsopenAccess
dc.subjectRNA-Seq
dc.subjectEstilbene sintase
dc.subjectResveratrol O-metiltransfesase
dc.titleAnotação funcional, classificação e expressão diferencial de fitoalexinas em cultivares de Vitis spp. inoculadas com Xanthomonas citri.
dc.typeTeses
dc.subject.thesagroUva
dc.subject.thesagroXanthomonas Citri
dc.subject.thesagroCancro Bacteriano
dc.subject.thesagroDefesa Vegetal
dc.subject.nalthesaurusResveratrol
dc.subject.nalthesaurusBacterial canker
dc.subject.nalthesaurusGrapes
dc.subject.nalthesaurusPlant diseases and disorders
dc.description.notesDissertação (Mestrado em Produção Vegetal) - Universidade Federal do Vale do São Francisco, Petrolina. Orientada por Natoniel Franklin de Melo, Embrapa Semiárido.
dc.format.extent257 f.
riaa.ainfo.id1175419
riaa.ainfo.lastupdate2025-05-08
dc.contributor.institutionMARIA POLIANA MARTINS PEREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO.
Appears in Collections:Tese/dissertação (CPATSA)

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