Título:	Viabilidade da extração de DNA em amostras de café torrado com degradação genômica.
Autoria:	SOUZA, A. M. de FREITAS-SILVA, O. SILVA, B. V. da BUSSO, C. SCHNEIDER, R. TEIXEIRA, A. da S. PONTES, G. NICOLODELLI, G.
Afiliação:	ANDRESSA MOREIRA DE SOUZA, CTAA; OTNIEL FREITAS SILVA, CTAA; BRUNA VALETIM DA SILVA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ESTADO DO RIO DE JANEIRO; CLEVERSON BUSSO, UNIVERSIDADE TECNOLÓGICA FEDERAL DO PARANÁ; RICARDO SCHNEIDER, UNIVERSIDADE TECNOLÓGICA FEDERAL DO PARANÁ; ALESSANDRA DA SILVA TEIXEIRA, CTAA; GUSTAVO PONTES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA CATARINA; GUSTAVO NICOLODELLI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SANTA CATARINA.
Ano de publicação:	2025
Referência:	In: CORDEIRO, C. A. M.; BARRETO, N. S. E.; SANCHES, A. L .G. (org.). Avanços, inovações e saberes em ciência e tecnologia de alimentos, v. 5, cap. 10, p. 173-187, 2025.
Conteúdo:	O presente estudo teve como objetivo avaliar diferentes protocolos de extração de DNA em amostras de café, tanto verde quanto torrado, visando estabelecer um método capaz de garantir maior eficiência nas reações de qPCR utilizadas para genotipagem de espécies de café com elevado grau de degradação do DNA genômico, uma vez que o processo de torra compromete a pureza do DNA isolado e reduz significativamente a quantidade disponível para extração. Métodos: Foram analisadas amostras de café torrado, classificadas como escuro na escala de 35 Agtron, e de café verde provenientes de seis estados. Essas amostras foram submetidas à extração de DNA utilizando cinco protocolos de kits comerciais e seis protocolos desenvolvidos in house. Em seguida, foram conduzidas reações de amplificação para avaliar tanto a pureza do DNA obtido quanto a eficiência dos diferentes protocolos testados. Resultados: Os pro- tocolos correspondentes aos métodos (E) e (K) demonstraram os resultados mais satisfatórios, tanto em relação à pureza do DNA obtido quanto à eficiência das reações de amplificação. Conclusão: O protocolo in house do método (K), desenvolvido neste estudo, gerou DNA com qualidade adequada para análises de qPCR, permitindo a genotipagem das espécies de C. arabica e C. canephora por meio de discriminação alélica, após a aplicação da técnica de pré-amplificação.
NAL Thesaurus:	Coffea
Palavras-chave:	Discriminação Alélica Genotipagem Protocolo de Extração Kit
Digital Object Identifier:	https://doi.org/10.37885/251120584
Tipo do material:	Parte de livro
Acesso:	openAccess
Aparece nas coleções:	Capítulo em livro científico (CTAA)