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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1187129Registro completo de metadados
| Campo DC | Valor | Idioma |
|---|---|---|
| dc.contributor.author | GONÇALVES, G. F. F. | |
| dc.contributor.author | BEGNAMI, I. dos S. | |
| dc.contributor.author | MALAGO JUNIOR, W. | |
| dc.contributor.author | GUSMAO, M. R. | |
| dc.contributor.author | VIGNA, B. B. Z. | |
| dc.date.accessioned | 2026-05-26T20:48:38Z | - |
| dc.date.available | 2026-05-26T20:48:38Z | - |
| dc.date.created | 2026-05-26 | |
| dc.date.issued | 2025 | |
| dc.identifier.citation | In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA DE SÃO CARLOS, 17., 2025, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: 2025. p. 30. | |
| dc.identifier.issn | 2966-0289 | |
| dc.identifier.uri | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1187129 | - |
| dc.description | Os cercopídeos são insetos sugadores caracterizados como praga significativa em poáceas, incluindo forrageiras e a cana-de-açúcar. Recentemente espécies pertencentes ao gênero Mahanarva (comumente associado com gramíneas de grande porte) têm constituído pragas importantes também em pastagens. Atualmente, poucas opções de controle são viáveis, sendo o RNA de interferência (RNAi) um método promissor devido à sua alta especificidade e eficiência, além de causar menor impacto ambiental. Considerando que diferentes espécies podem apresentar níveis distintos de adaptação e especificidade ao hospedeiro, nosso objetivo foi identificar diferenças nos perfis de expressão gênica dentro do gênero Mahanarva que possam estar relacionados à mecanismos de adaptação ou potencial diferencial para controle por RNAi. Para isso realizamos uma análise comparativa de transcriptomas de duas espécies (M. spectabilis e M. fimbriolata), uma comumente associada a forrageiras e outra especializada em cana-de-açúcar. A partir de indivíduos adultos, ninfas e ovos coletados em condições naturais foi realizada a extração de RNA total (kit Quick-RNA Tissue/Insect Microprep ou protocolo TRIzol), construção de bibliotecas de DNA complementar (kit TruSeq Stranded mRNA) e sequenciamento na plataforma Illumina NextSeq 550. Para averiguar a qualidade e integridade das extrações utilizamos Nanodrop e eletroforese em gel de agarose 1% corado com brometo de etídeo, onde as concentrações apresentaram valor médio de 565,20 ng/μL e para a grande maioria das amostras houve a formação de banda única e intensa. A qualidade dos dados obtidos no sequenciamento foi avaliada com FastQC, as sequências de baixa qualidade e os adaptadores foram cortadas com Trimmomatic e o RNA ribossomal residual foi filtrado com SortMeRNA. Os transcriptomas foram montados pela abordagem de novo utilizando o software Trinity, devido à ausência de genoma de referência para a espécie. Filtramos a redundância com o programa cd-hit e verificamos a qualidade com o BUSCO e o Bowtie2. As montagens de M. fimbriolata e M. spectabilis resultaram em 253.894 e 197.003 contigs, respectivamente. Para identificar genes ortólogos entre as espécies, realizamos alinhamentos cruzados com BLASTn, aplicando filtros de identidade ≥ 80%, comprimento ≥ 100 pb e e-value ≤ 1e-5. Dos contigs de M. fimbriolata, 145.541 (57,3%) apresentaram similaridade com transcritos de M. spectabilis, enquanto 108.353 (42,7%) foram considerados exclusivos. No sentido inverso, 133.734 contigs de M. spectabilis (67,9%) apresentaram hits em M. fimbriolata, e 63.268 (32,1%) foram exclusivos. Com base na abordagem de Reciprocal Best Hits (RBH), identificamos 99.050 pares de transcritos ortólogos putativos compartilhados entre as espécies. | |
| dc.language.iso | por | |
| dc.relation.ispartofseries | (Embrapa Pecuária Sudeste. Eventos Técnicos & Científicos, 4) | |
| dc.rights | openAccess | |
| dc.subject | RNAi | |
| dc.subject | RNA-Seq | |
| dc.title | Análise comparativa de transcriptomas de duas espécies de cercopídeos do gênero Mahanarva (Hemiptera: Cercopidae) com importância agrícola distinta. | |
| dc.type | Resumo em anais e proceedings | |
| dc.subject.thesagro | RNA | |
| dc.subject.thesagro | Cigarrinha das Pastagens | |
| dc.subject.thesagro | Gramínea | |
| dc.description.notes | Financiamento: CNPq | PIBIC/PIBIT (170909/2023-9) | |
| riaa.ainfo.id | 1187129 | |
| riaa.ainfo.lastupdate | 2026-05-26 | |
| dc.contributor.institution | GUSTAVO FERNANDO FERREIRA GONÇALVES, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; ISABELA DOS SANTOS BEGNAMI, UNIVERSIDADE ESTADUAL DE CAMPINAS; WILSON MALAGO JUNIOR, CPPSE; MARCOS RAFAEL GUSMAO, CPPSE; BIANCA BACCILI ZANOTTO VIGNA, CPPSE. | |
| Aparece nas coleções: | Resumo em anais de congresso (CPPSE)![]() ![]() | |
Arquivos associados a este item:
| Arquivo | Tamanho | Formato | |
|---|---|---|---|
| 2025-cppse-anais-17-bbzv-analise-comparativa-transcriptomas-duas-especies-cercopideos-genero-mahanarva-importancia-agricola-distinta-p-30.pdf | 1,43 MB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |







