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Campo DCValorLengua/Idioma
dc.contributor.authorSALES, R. M. O. B.
dc.contributor.authorANDRADE, A. C.
dc.contributor.authorSILVA, F. R. da
dc.date.accessioned2026-07-08T17:51:49Z-
dc.date.available2026-07-08T17:51:49Z-
dc.date.created2005-12-27
dc.date.issued2005
dc.identifier.citationIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 4., 2005, Londrina. Anais... Londrina: IAPAR; Brasília, DF: Embrapa Café, 2005.
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/186598-
dc.descriptionO Projeto Genoma Café gerou seqüências parciais de mais de duzentos mil clones de EST (Expressed Sequence Tag). Essa estratégia gera dados redundantes. Nesse trabalho, selecionamos o conjunto mínimo de clones que representam todos os transcritos encontrado no projeto. Para tanto, as 213.157 seqüências geradas pelo projeto, apos um processo criterioso que resultou em 145.507 seqüências limpas, foram agrupadas por similaridade dando origem a 32.958 possíveis transcritos, aqui chamados de Unigenes. Para cada Unigene, determinamos o clone correspondente à extremidade 5' o que, pela metodologia empregada na construção das bibliotecas, deve corresponder ao clone de maior extensão. Todos os resultados obtidos foram centralizados e organizados em uma base de dados relacional, de forma a facilitar sua utilização em posteriores aplicações de diferentes plataformas e linguagens. O SGDB usado foi o PostgreSQL. Desenvolvemos uma interface Web usando as linguagens PHP e Perl rodando sobre o Apache para permitir a usuários acesso aos dados de maneira simplificada e rápida. Escolhemos essas ferramentas por serem todas de código livre, permitindo personalizações, se necessárias, e por não agregarem nenhum vinculo de licença.
dc.format1 CD ROM.
dc.language.isopor
dc.rightsopenAccess
dc.subjectBioinformática
dc.subjectEST
dc.subjectGenômica
dc.subjectBancos de dados
dc.titleDeterminação do unigene do projeto genoma café.
dc.typeArtigo em anais e proceedings
dc.subject.nalthesaurusCoffea
dc.description.notesNúcleo: Biotecnologia aplicada à cadeia agroindustrial do café, p. 1.
riaa.ainfo.id186598
riaa.ainfo.lastupdate2026-07-08
Aparece en las colecciones:Artigo em anais de congresso (CENARGEN)

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