Title:	Uma ferramenta WEB para identificação e visualização de sequências repetitivas em lócus gênico de animais e plantas.
Authors:	HERAI, R. H. YAMAGISHI, M. E. B.
Affiliation:	ROBERTO H. HERAI, Doutorando em Genética e Biologia Molecular/UNICAMP; MICHEL EDUARDO BELEZA YAMAGISHI, CNPTIA.
Date Issued:	2009
Citation:	Campinas: EMBRAPA-CNPTIA, 2009.
Description:	Sequências repetitivas (SR) em lócus gênico de animais e plantas podem estar envolvidas em diversos fenômenos biológicos, como interferência por RNAi (Fire et al., 1998) e trans-splicing (Di Segni et al., 2008). A maioria das SR localiza-se em regiões de introns e, usualmente, seus estudos envolvem apenas sequências de mRNA, sendo necessário a estrutura intron-exon dos genes. Desta forma, é preciso realizar um mapeamento dos genes em seu respectivo genoma de referência para identificação de quatro tipos de SR: repetição reversa e complementar, repetição direta e complementar, repetição reversa e repetição direta. Este trabalho apresenta uma ferramenta WEB, chamada RepGraph, a qual integra algoritmos e ferramentas de bioinformática para identificar os pares que formam cada tipo de SR e uma representação gráfica para ilustrar sua relação em dois lócus gênicos.
NAL Thesaurus:	Bioinformatics Genomics
Keywords:	Ferramenta Web Sequências repetitivas em lócus gênico Bioinformática RepGraph Genômica Web tool
Notes:	Trabalho apresentado na V Mostra de Trabalhos de Estagiários e Bolsistas, Campinas, out. 2009.
Type of Material:	Resumo em anais e proceedings
Access:	openAccess
Appears in Collections:	Resumo em anais de congresso (CNPTIA)