Identificação de clones BAC com marcadores moleculares visando a integração de mapas físicos e genéticos.

CAÇÃO, S. M. B.; SILVA, N. V.; VIEIRA, L. G. E.; PEREIRA, L. F. P.

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Campo DC	Valor	Lengua/Idioma
dc.contributor.author	CAÇÃO, S. M. B.	pt_BR
dc.contributor.author	SILVA, N. V.	pt_BR
dc.contributor.author	VIEIRA, L. G. E.	pt_BR
dc.contributor.author	PEREIRA, L. F. P.	pt_BR
dc.date.accessioned	2011-10-26T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.accessioned	2011-10-26T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.available	2011-10-26T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.available	2011-10-26T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.created	2011-10-26	pt_BR
dc.date.issued	2011	pt_BR
dc.identifier.citation	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/904211	pt_BR
dc.description	Bibliotecas BAC (Cromossomo Artificial de Bactéria) têm sido muito utilizadas para suporte de trabalhos de mapeamento físico, clonagem posicional, mapeamento comparativo e estudos de evolução de genomas. Visando realizar o mapeamento físico em Coffea arabica, iniciamos a identificação e caracterização de clones BAC de uma biblioteca de C. arabica hibrido timor 832/2. A biblioteca contém 56.832 clones BACs com tamanho médio de 120 Kb, representando uma cobertura de 5,5 vezes o tamanho do genoma do C. arabica. Os clones da biblioteca BAC foram inicialmente agrupados em pools de placa com 384 clones, e superpools contendo 15 pools de placa o que representa 5.760 clones. A identificação do BAC de interesse foi realizada através da seleção por PCR nos superpools e pools, seguida por hibridização em filtros de colônia contendo 384 clones. Para a seleção dos superpools e pools de placas foram utilizados os primers baseados em AFLPs relacionados com lócus de resistência à ferrugem (M-8, SAT-244 e BA-124). Também foram utilizados os marcadores SSR-18 (GL1), SSR-16 (GL2), ACGG-1 (GL3), CCG-3 (GL6), de quatro grupos de ligação do mapa genético parcial de C. arabica (Oliveira et al, 2007) visando identificar e posicionar BAC para cada grupo de ligação. Os BAC selecionados nas hibridizações foram confirmados através de extração individual do clones, seguida por PCR para checar a marca de interesse. Até o momento foram identificados 32 clones BAC para as marcas de resistência a ferrugem e 98 para os 4 grupos de ligação. Os BAC selecionados serão sequenciados para o mapeamento físico da região contendo lócus de resistência à ferrugem.	pt_BR
dc.language.iso	por	pt_BR
dc.rights	openAccess	pt_BR
dc.subject	Cromossomo artificial de bactéria	pt_BR
dc.subject	Mapeamento	pt_BR
dc.title	Identificação de clones BAC com marcadores moleculares visando a integração de mapas físicos e genéticos.	pt_BR
dc.type	Artigo em anais e proceedings	pt_BR
dc.date.updated	2014-10-07T11:11:11Z	pt_BR
dc.subject.thesagro	Ferrugem	pt_BR
riaa.ainfo.id	904211	pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate	2014-10-07	pt_BR
dc.contributor.institution	SANDRA MARIA BELLODI CAÇÃO, INCT/Café; NATHÁLIA VOLPI SILVA, CAPES; LUIZ GONZAGA ESTEVES VIEIRA, LBI-IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.	pt_BR
Aparece en las colecciones:	Artigo em anais de congresso (SAPC)

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