Título:	Localização de marcador molecular derivado de EST potencialmente associado ao domínio LRR em mapa genético de Coffea arabica.
Autoria:	ALVARENGA, S. M. CAIXETA, E. T. ANDRADE, F. T. MACIEL, B. H. ZAMBOLIM, E. M. XAVIER, K. V. SAKIYAMA, N. S.
Afiliação:	SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV/BIOAGRO; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; FLÁVIA THIEBAUT ANDRADE, UFV/BIOAGRO; BÁRBARA HUFNAGEL MACIEL, UFV/BIOAGRO; EUNIZE MACIEL ZAMBOLIM, UFV//BIOAGRO; KÁTIA VIANA XAVIER, UFV; NEY SUSSUMU SAKIYAMA, UFV/BIOAGRO.
Ano de publicação:	2007
Referência:	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 5., 2007, Águas de Lindóia, SP. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2007.
Conteúdo:	O Projeto Brasileiro do Genoma Café (PBGC) gerou um banco de dados de 200.000 ESTs (Expressed Sequence Tags). O banco de dados foi minerado por meio de análise in silico e 12009 seqüências potencialmente envolvidas na resistência do cafeeiro a doenças foram identificadas. A partir dessas seqüências foram desenhados 40 oligonucleotídeos, iniciadores específicos para amplificar seqüências do DNA genômico do cafeeiro. As condições de reação e amplificação dos iniciadores sintetizados foram ajustadas. Vinte e nove iniciadores amplificaram fragmentos de aproximadamente 400 pb, exibindo bandas únicas e bem definidas, e apenas um deles foi polimórfico entre os indivíduos resistentes e susceptíveis. O iniciador CARF 005 amplificou um fragmento nos 154 indivíduos F2 da população H464-2. Essa análise permitiu verificar o posicionamento desse marcador no grupo de ligação 9, a 36,2 cM do marcador K13c no mapa genético de Coffea arabica previamente desenvolvido com marcadores RAPD.
NAL Thesaurus:	Coffea
Palavras-chave:	Genoma café Oligonucleotídeos iniciadores específicos
Tipo do material:	Artigo em anais e proceedings
Acesso:	openAccess
Aparece nas coleções:	Artigo em anais de congresso (SAPC)