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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/946719
Title: | Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore. |
Authors: | SOMAVILLA, A. L.![]() ![]() HIGA, R. H. ![]() ![]() MUDADU, M. de A. ![]() ![]() ALENCAR, M. M. de ![]() ![]() REGITANO, L. C. de A. ![]() ![]() |
Affiliation: | ADRIANA LUIZA SOMAVILLA, Unesp; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURÍCIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE. |
Date Issued: | 2012 |
Citation: | In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012. |
Pages: | Não paginado. |
Description: | A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001). |
Thesagro: | Bos Indicus |
NAL Thesaurus: | Zebu Genotype Single nucleotide polymorphism Linkage disequilibrium |
Keywords: | Desequilíbrio de ligação Genotipagem |
Notes: | SBMA 2012. |
Type of Material: | Artigo em anais e proceedings |
Access: | openAccess |
Appears in Collections: | Artigo em anais de congresso (CNPTIA)![]() ![]() |
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