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Research center of Embrapa/Collection: Embrapa Florestas - Artigo em periódico indexado (ALICE)
Date Issued: 2013
Type of Material: Artigo em periódico indexado (ALICE)
Authors: SILVA, F. F.
ROCHA, G. S.
RESENDE, M. D. V. de
GUIMARÃES, S. E. F.
PETERNELLI, L. A.
DUARTE, D. A. S.
AZEVEDO, C.
Additional Information: F. F. Silva, Universidade Federal de Viçosa; G. S. Rocha, Aluno de pós-graduação – Universidade Federal de Viçosa; MARCOS DEON VILELA DE RESENDE, CNPF; S. E. F. Guimarães, Universidade Federal de Viçosa; L. A. Peternelli, Universidade Federal de Viçosa; D. A. S. Duarte, Aluno de graduação - Universidade Federal de Viçosa / Bolsista de Iniciação Científica; C. Azevedo, Universidade Federal de Viçosa.
Title: Seleção genômica ampla para curvas de crescimento.
Publisher: Arquivo Brasileiro de Medicina Veterinária e Zootecnia, v. 65, n. 5, p. 1519-1526, 2013.
Language: pt_BR
Keywords: Melhoramento genético
SNP
Dados longitudinais
LASSO bayesiano
Longitudinal data
Bayesian LASSO
Description: Foi proposta uma metodologia para avaliação genética de curvas de crescimento considerando-se informações de marcadores SNPs (Single Nucleotide Polymorphisms). Em um primeiro passo foram ajustados modelos de crescimento não lineares (logístico) aos dados de peso-idade de cada animal, e em um segundo passo as estimativas dos parâmetros de tais modelos foram consideradas como fenótipos em um modelo de regressão (LASSO Bayesiano ? BL) cujas covariáveis foram os genótipos dos marcadores SNPs. Este enfoque possibilitou estimar os valores genéticos genômicos (GBV) para peso em qualquer tempo da trajetória de crescimento, refletindo na confecção de curvas de crescimento genômicas, as quais permitiram a identificação de grupos de indivíduos geneticamente superiores em relação à eficiência de crescimento. Os dados simulados utilizados neste estudo foram constituídos de 2000 indivíduos (1000 na população de treinamento e 1000 na população de validação) contendo 453 marcadores SNPs distribuídos sobre cinco cromossomos. Os resultados indicaram a alta eficiência do método BL em predizer GBVs da população de validação com base na população de treinamento (coeficientes de correlação variaram entre 0,79 e 0,93), bem como a alta eficiência na detecção de QTLs, uma vez que os marcadores com maiores efeitos estimados encontravam-se em posições dos cromossomos próximas àquelas nas quais se encontravam os verdadeiros QTLs postulados na simulação.
Data Created: 2013-12-19
Appears in Collections:Artigo em periódico indexado (CNPF)

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