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Campo DCValorLengua/Idioma
dc.contributor.authorSILVA, B. S. R. dapt_BR
dc.contributor.authorCAÇÃO, S. B.pt_BR
dc.contributor.authorIVAMOTO, S. T.pt_BR
dc.contributor.authorSILVA, J. C.pt_BR
dc.contributor.authorDOMINGUES, D. S.pt_BR
dc.contributor.authorPEREIRA, L. F. P.pt_BR
dc.date.accessioned2014-01-07T11:11:11Zpt_BR
dc.date.available2014-01-07T11:11:11Zpt_BR
dc.date.created2014-01-07pt_BR
dc.date.issued2013pt_BR
dc.identifier.citationIn: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/975072pt_BR
dc.descriptionO café é uma das principais commodities agrícolas mundiais, sendo consumido regularmente por 40% de toda população. As espécies, Coffea arabica L. e Coffea canephora P. são as de maior importância respondendo por 65% e 35% da produção mundial, respectivamente. Em C. arabica , o desenvolvimento de novas cultivares é demorado, podendo levar mais de 20 anos para finalização dos trabalhos. Além disso, estreita base genética de C. arabica dificulta a obtenção de cultivares resistentes a várias pragas e doenças, assim como uma maior tolerância a estresses abióticos. A utilização de marcadores moleculares para análise da diversidade e seleção de genótipos representa uma importante ferramenta para auxiliar o melhoramento e tentar diminuir esses problemas. Neste trabalho foi realizada identificação e análise in silico de SSR?s a partir de dados de RNA-seq de Iapar 59 e de sequências de BACs de Hibrido de Timor 832/2 (CaHT). Para Iapar 59 foram analisados 77 contigs, encontrados 39 SSR?s e desenhados 21 pares de oligonucleotídeos. Para CaHT foram analisados também 77 contigs, encontrados 35 SSR?s e desenhados 29 pares de oligonucleotídeos. Os motivos com maior frequência foram di, tri e tetranucleotídeos, sendo (AT) no motivo mais frequente entre os dois genótipos. Esta busca de sequências repetitivas é de grande importância para futura validação e aumento desses marcadores para estudos de diversidade genética, mapeamento, e a ssociação com características agronômicas de interesse.pt_BR
dc.language.isoporpt_BR
dc.rightsopenAccesspt_BR
dc.subjectMarcador SSRpt_BR
dc.subjectAnálise in silicopt_BR
dc.subjectRNA-seqpt_BR
dc.subjectCromossomo artificial de bactériapt_BR
dc.titleIdentificação e caracterização de microssatélites de Coffea arabica a partir de dados de sequenciamento de RNA e de BACS.pt_BR
dc.typeArtigo em anais e proceedingspt_BR
dc.date.updated2014-01-07T11:11:11Zpt_BR
riaa.ainfo.id975072pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate2014-01-07pt_BR
dc.contributor.institutionBRUNA SILVESTRE RODRIGUES DA SILVA, Bolsista Consórcio Pesquisa Café; SANDRA BELLODI CAÇÃO, UEL; SUZANA TIEMI IVAMOTO, UEL; JULIANA COSTA SILVA, Bolsista IAPAR; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.pt_BR
Aparece en las colecciones:Artigo em anais de congresso (SAPC)

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