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Research center of Embrapa/Collection: Embrapa Café - Artigo em anais de congresso (ALICE)
Date Issued: 2013
Type of Material: Artigo em anais de congresso (ALICE)
Authors: IVAMOTO, S. T.
REIS JUNIOR, O.
CARAZZOLLE, M. F.
DOMINGUES, D. S.
PEREIRA, L. F. P.
Additional Information: SUZANA TIEMI IVAMOTO, UEL; OSVALDO REIS JUNIOR, UNICAMP; MARCELO FALSARELLA CARAZZOLLE, UNICAMP; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.
Title: Transcriptoma de frutos de Coffea arabica L. ao longo do seu desenvolvimento inicial.
Publisher: In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 8., 2013, Salvador. Sustentabilidade e inclusão Social. Brasília, DF: Embrapa Café, 2013.
Language: pt_BR
Keywords: RNA-Seq
Transcriptoma
Illumina
Description: Neste trabalho foi realizado o seqüenciamento de RNA em larga escala de 12 bibliotecas de Coffea arabica cv. IAPAR59: folha, flor, frutos ao longo do seu desenvolvimento e frutos tratados com o indutor de metabolismo secundário metiljasmonato. Foram gerados no total 84.798.835 sequências (Illumina, HiSeq2000), que foram montadas em 127.600 contigs com tamanho médio de 1264bp, dos quais 65480 foram considerados como variantes de splicing únicos (unigenes). Neste trabalho, reportamos a montagem de novo do transcriptoma realizada com as sequências destas bibliotecas e os dados preliminares de anotação funcional e categorização. Trata-se do primeiro trabalho de sequenciamento Illumina com frutos de cafeeiro, que pode trazer importantes informações sobre genes candidatos relacionados a produção de compostos-chave envolvidos na qualidade do café e maturação de frutos.
Thesagro: Coffea arabica
Data Created: 2014-01-08
Appears in Collections:Artigo em anais de congresso (SAPC)

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