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dc.contributor.authorIVAMOTO, S. T.pt_BR
dc.contributor.authorPOT, D.pt_BR
dc.contributor.authorLANNES, S. D.pt_BR
dc.contributor.authorDOMINGUES, D. S.pt_BR
dc.contributor.authorVIEIRA, L. G. E.pt_BR
dc.contributor.authorPEREIRA, L. F. P.pt_BR
dc.date.accessioned2014-05-16T22:32:34Z-
dc.date.available2014-05-16T22:32:34Z-
dc.date.created2014-05-16pt_BR
dc.date.issued2013pt_BR
dc.identifier.citationCoffee Science, Lavras, v. 8, n. 2, p. 148-156, abr./jun. 2013.pt_BR
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/986384pt_BR
dc.descriptionOs ácidos clorogênicos (CGAs) são compostos químicos importantes de Coffea spp. para a qualidade da bebida, pois eles interferem na adstringência e podem alterar o aroma e sabor da bebida. Aproximadamente 310.000 ESTs de Coffea estão disponíveis e possibilitam o acesso à variabilidade nucleotídica da planta e o desenvolvimento de marcadores moleculares ligados à qualidade da bebida para as principais enzimas da via de biossíntese dos CGAs: PAL, C4H, 4CL, CQT e C3?H. Neste trabalho foram detectados polimorfismos dos tipos SNP, INDEL ou SSR dentro das sequências nucleotídidicas disponíveis no Projeto Genoma Café e no NCBI. As sequências de ESTs de CGAs foram clusterizadas pelo programa Codon Code Aligner, assim como a detecção de polimorfismos e validação dos mesmos (qualidade de cromatograma). Foram identificadas seis isoformas para PAL, uma para C4H, seis para 4CL, duas para CQT e duas para C3?H. Os contigs formados apresentaram um total de 248 polimorfismos (236 SNPs e 12 INDELs), sendo 201 na região codante (127 não sinônimos e 74 sinônimos). A frequência dos polimorfismos foi maior nas regiões UTRs (1pol/54pb), em relação à codante (1pol/81pb). A análise das sequências de C. arabica permitiu a identificação de 2 subgrupos diferentes de sequências, referentes aos seus genomas ancestrais (C. canephora e C. eugenioides). Foi observada a presença de 67,4% dos polimorfismos entre os grupos ancestrais e 32,6% dentro dos grupos em C. arabica. Esses resultados vêm permitindo definir genes tanto para estudos de expressão de homeólogos de CGAs como para o desenvolvimento de marcadores moleculares para o mapeamento genético.pt_BR
dc.language.isoporpt_BR
dc.rightsopenAccesspt_BR
dc.subjectSNPspt_BR
dc.subjectSSRspt_BR
dc.subjectESTspt_BR
dc.subjectCGAspt_BR
dc.titleDiversidade nucleotídica de genes envolvidos na biossíntese de ácidos clorogênicos de cafeeiros.pt_BR
dc.typeArtigo de periódicopt_BR
dc.date.updated2014-05-16T22:32:34Zpt_BR
dc.subject.thesagroPolimorfismopt_BR
dc.subject.thesagroMarcador molecularpt_BR
riaa.ainfo.id986384pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate2014-05-16pt_BR
dc.contributor.institutionSUZANA TIEMI IVAMOTO, Universidade Estadual de Lodrina; DAVID POT, CIRAD; SERGIO DIAS LANNES, EPAGRI; DOUGLAS SILVA DOMINGUES, IAPAR; LUIZ GONZAGA ESTEVES VIEIRA, IAPAR; LUIZ FILIPE PROTASIO PEREIRA, SAPC.pt_BR
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