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Research center of Embrapa/Collection: Embrapa Informática Agropecuária - Artigo em anais de congresso (ALICE)
Date Issued: 2012
Type of Material: Artigo em anais de congresso (ALICE)
Authors: SOMAVILLA, A. L.
HIGA, R. H.
MUDADU, M. de A.
ALENCAR, M. M. de
REGITANO, L. C. de A.
Additional Information: ADRIANA LUIZA SOMAVILLA, Unesp; ROBERTO HIROSHI HIGA, CNPTIA; MAURÍCIO DE ALVARENGA MUDADU, CPPSE; MAURICIO MELLO DE ALENCAR, CPPSE; LUCIANA CORREIA DE ALMEIDA REGITANO, CPPSE.
Title: Caracterização de haplótipos e identificação de assinaturas de seleção em bovinos da raça Nelore.
Publisher: In: SIMPÓSIO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO ANIMAL, 9., 2012, João Pessoa. Anais... João Pessoa: SBMA, 2012.
Pages: Não paginado.
Language: pt_BR
Notes: SBMA 2012.
Keywords: Desequilíbrio de ligação
Genotipagem.
Description: A identificação de regiões do genoma que controlam características de interesse econômico e que estejam sob seleção é possível por conta da disponibilidade da genotipagem em plataformas de altas densidades de polimorfismos de único nucleotídeo (SNPs). A busca por assinaturas de seleção avalia, principalmente, altas e não usuais frequências alélicas dos loci adjacentes às mutações favoráveis. Com o objetivo de detectar evidências de assinaturas de seleção recente no genoma de bovinos da raça Nelore, foram genotipados 796 indivíduos com o chip Illumina BovineHD BeadChip, que possui mais de 777 mil SNPs e, posteriormente, inferida a fase de ligação dos SNPs e a reconstrução dos blocos de desequilíbrio de ligação (haplótipos). A detecção de assinaturas de seleção recentes foi realizada por meio da aplicação da metodologia EHH (homozigose do haplótipo estendido). 330.262 SNPs entraram na formação dos 68.054 haplótipos identificados, cobrindo 42% do genoma, sendo que a maior parte deles apresentou até 10 kb de comprimento e foram formados por 3 marcadores. Além disso, foram detectadas regiões de possíveis assinaturas de seleção com diferentes significâncias: 2.103 (P<0,01), 269 (P<0,001) e 31 (P<0,0001).
Thesagro: Bos Indicus.
NAL Thesaurus: Zebu
Genotype
Single nucleotide polymorphism
Linkage disequilibrium
Data Created: 2013-01-29
Appears in Collections:Artigo em anais de congresso (CNPTIA)

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