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| Ano de publicação | Título | Autor(es) |
| 2007 | An indirect evidence of the Fibonacci String model for DNA repetitive sequence growth. | YAMAGISHI, M. E. B.  ; FALCÃO, P. R. K.; VIEIRA, F. D.; HERAI, R. H. |
| 2006 | An integrated database of structural parameters for protein analysis. | OLIVEIRA, S. R. de M.; ALMEIDA, G. V.; SOUZA, K. R. R.; RODRIGUES, D. N.; NESHICH, G.; FALCAO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G. |
| 2006 | Analysing protein-protein interface using JPIV. | YAMAGISHI, M. E. B.; FALCAO, P. R. K.; BORRO, L. C.; OLIVEIRA, S. R. de M.; SANTOS, E. H. dos; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; NESHICH, G. |
| 2020 | Aplicações da bioinformática na agricultura. | ZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. |
| 2023 | Applications of bioinformatics in agriculture. | ZERLOTINI NETO, A.; NHANI JÚNIOR, A.; VIEIRA, F. D.; CINTRA, L. C.; MUDADU, M. de A.; FALCÃO, P. R. K.; GIACHETTO, P. F. |
| 2016 | BDGF: a database and webbased information retrieval system for genotype and phenotype. | VIEIRA, F. D.; MOURA, D. G. de; SILVA, D. F. da; HIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A. |
| 2017 | BDGF: um sistema web para recuperação de informação de genótipos e fenótipos. | VIEIRA, F. D.; MOURA, D. G. de; SILVA, D. F.; HIGA, R. H.; ZERLOTINI NETO, A. |
| 2006 | BlueStar STING - a multiplatform environment for protein structure analysis. | KUSER, P.; YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; BORRO, L. C.; NESHICH, G. |
| 2010 | Detecção de erros de montagens em regiões gênicas. | HERAI, R. H.; GIACHETTO, P. F.; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos; YAMAGISHI, M. E. B.; KUSER-FALCÃO, P. R. |
| 2007 | GMP- RAM V1.1: Uma proposta de software como sistema de suporte à decisão para avaliação de risco de plantas geneticamente modificadas. | JESUS, K. R. E. de; VIEIRA, F. D.; LIMA, D. U. de |
| 2007 | GMP- RAM V1.1: Uma proposta de software como sistema de suporte à decisão para avaliação de risco de plantas geneticamente modificadas. | JESUS, K. R. E. de; VIEIRA, F. D.; LIMA, D. U. de |
| 2006 | GMP-RAM v1.1: a proposed software tool to support the method for risk assessment of genetically modified plants. | JESUS, K. R. E. de; VIEIRA, F. D.; LIMA, D. U. de |
| 2007 | GMP-RAM V1.1: uma proposta de software como sistema de suporte à decisão para avaliação de risco de plantas geneticamente modificadas. | JESUS, K. R. E. de; VIEIRA, F. D.; LIMA, D. U. de |
| 2010 | Laboratório avançado multiusuário de bioinformática da Embrapa. | KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; GIACHETTO, P.; SILVA, F. R. da; VIEIRA, F. D.; SANTOS, E. H. dos |
| 2015 | Metodologia baseada em técnicas de mineração de dados para suporte à certificação de raças de ovinos. | VIEIRA, F. D.; OLIVEIRA, S. R. de M.; PAIVA, S. R. |
| 2014 | Mineração de dados: conceitos e um estudo de caso sobre certificação racial de ovinos. | VIEIRA, F. D.; OLIVEIRA, S. R. de M. |
| 2006 | PDB-Metrics: a web tool for exploring the PDB contents. | FILETO, R.; KUSER, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; RIBEIRO, A. A.; QUINALIA, T. G.; FRANCO, E. H.; MANCINI, A. L.; HIGA, R. H.; OLIVEIRA, S. R. M.; SANTOS, E. H.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; CRUZ, S. A. B.; NESHICH, G. |
| 2006 | Predicting enzyme class from protein structural parameters and bagging predictors. | YAMAGISHI, M. E. B.; OLIVEIRA, S. R. M.; BORRO, L. C.; SANTOS, E. H.; JARDINE, J. G.; VIEIRA, F. D.; MAZONI, I.; NARCISO, M. G.; KUSER-FALCÃO, P. R.; NESHICH, G. |
| 2006 | STING database quality assessment. | OLIVEIRA, S. R. de M.; FALCÃO, P. R. K.; YAMAGISHI, M. E. B.; NESHICH, G.; RODRIGUES, D. N.; SOUZA, K. R. R.; MORITA, D. U.; ALMEIDA, G. V.; MAZONI, I.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G. |
| 2007 | Sting_RDB: a relational database of structural parameters for protein analysis with support for data warehousing and data mining. | OLIVEIRA, S. R. de M.; ALMEIDA, G. V.; SOUZA, K. R. R.; RODRIGUES, D. N.; KUSER-FALCÃO, P. R.; YAMAGISHI, M. E. B.; SANTOS, E. H. dos; VIEIRA, F. D.; JARDINE, J. G.; NESHICH, G. |
