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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415
Registro completo de metadados
Campo DC | Valor | Idioma |
---|---|---|
dc.contributor.author | OLIVEIRA, J. C. de | |
dc.contributor.author | SILVA, A. L. D. da | |
dc.contributor.author | SILVA, C. C. da | |
dc.contributor.author | SOUZA, A. P. de | |
dc.contributor.author | FORMIGHIERI, E. F. | |
dc.contributor.author | CAMPOS, T. de | |
dc.date.accessioned | 2020-10-10T09:17:19Z | - |
dc.date.available | 2020-10-10T09:17:19Z | - |
dc.date.created | 2020-10-09 | |
dc.date.issued | 2020 | |
dc.identifier.citation | In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2., 2019, Rio Branco, AC. A Contribuição da ciência para a agropecuária no Acre: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2020. | |
dc.identifier.uri | http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415 | - |
dc.description | O uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi extraído e utilizado para montagem das bibliotecas, as quais foram sequenciadas e tiveram seu genoma funcional montado com o software Trinity® e metodologia de novo. Um total de 336 milhões de reads foi obtido, dos quais 84.229 foram utilizados na identificação de microssatélites. Dos 4.461 marcadores encontrados, 186 foram selecionados para validação e 80 (43%) apresentaram perfil ideal de amplificação. Desses 80, 29 foram genotipados e apresentaram-se polimórficos. Foi possível acessar a diversidade genética em 20 genótipos. Esses dados indicam a informatividade dos novos marcadores, os quais poderão contribuir para acelerar o melhoramento do amendoim forrageiro. | |
dc.format | Banner. | |
dc.language.iso | por | |
dc.relation.ispartofseries | (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 2). | |
dc.rights | openAccess | pt_BR |
dc.subject | Amendoim forrageiro | pt_BR |
dc.subject | Forage peanut | pt_BR |
dc.subject | Cacahuetes forrajeros | pt_BR |
dc.subject | RNA-Seq | pt_BR |
dc.subject | RNA sequencing | pt_BR |
dc.subject | Belomonte | pt_BR |
dc.subject | Amarillo MG-100 | pt_BR |
dc.subject | Genoma funcional | pt_BR |
dc.subject | Cultivo mixto | pt_BR |
dc.subject | Pastos forrajeros | pt_BR |
dc.subject | Leguminosas forrajeras | pt_BR |
dc.subject | Repeticiones de microsatélite | pt_BR |
dc.subject | Análisis de secuencia | pt_BR |
dc.subject | Embrapa Acre | pt_BR |
dc.subject | Rio Branco (AC) | pt_BR |
dc.subject | Acre | pt_BR |
dc.subject | Amazônia Ocidental | pt_BR |
dc.subject | Western Amazon | pt_BR |
dc.subject | Amazonia Occidental | pt_BR |
dc.title | Caracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites. | |
dc.type | Artigo em anais e proceedings | |
dc.subject.thesagro | Pastagem Consorciada | |
dc.subject.thesagro | Leguminosa Forrageira | pt_BR |
dc.subject.thesagro | Gramínea Forrageira | pt_BR |
dc.subject.thesagro | Marcador Genético | pt_BR |
dc.subject.thesagro | Banco de Germoplasma | pt_BR |
dc.subject.nalthesaurus | Mixed cropping | pt_BR |
dc.subject.nalthesaurus | Forage grasses | pt_BR |
dc.subject.nalthesaurus | Forage legumes | pt_BR |
dc.subject.nalthesaurus | Arachis pintoi | pt_BR |
dc.subject.nalthesaurus | Microsatellite repeats | pt_BR |
dc.subject.nalthesaurus | Sequence analysis | pt_BR |
dc.subject.nalthesaurus | Germplasm conservation | pt_BR |
dc.description.notes | Editores técnicos: Virgínia de Souza Álvares; Fabiano Marçal Estanislau. | |
dc.format.extent2 | p. 83-88. | |
riaa.ainfo.id | 1125415 | |
riaa.ainfo.lastupdate | 2020-10-14 -03:00:00 | |
dc.contributor.institution | Jônatas Chagas de Oliveira, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Genéticos da Rede Bionorte, Universidade Federal do Acre; André Lucas Domingos da Silva, Programa de Pós-Graduação em Ciência, Inovação e Tecnologia para a Amazônia, Universidade Federal do Acre; Carla Cristina da Silva, Universidade Estadual de Campinas; Anete Pereira de Souza, Universidade Estadual de Campinas; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC. | |
Aparece nas coleções: | Artigo em anais de congresso (CPAF-AC) |
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Arquivo | Descrição | Tamanho | Formato | |
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