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dc.contributor.authorOLIVEIRA, J. C. de
dc.contributor.authorSILVA, A. L. D. da
dc.contributor.authorSILVA, C. C. da
dc.contributor.authorSOUZA, A. P. de
dc.contributor.authorFORMIGHIERI, E. F.
dc.contributor.authorCAMPOS, T. de
dc.date.accessioned2020-10-10T09:17:19Z-
dc.date.available2020-10-10T09:17:19Z-
dc.date.created2020-10-09
dc.date.issued2020
dc.identifier.citationIn: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 2., 2019, Rio Branco, AC. A Contribuição da ciência para a agropecuária no Acre: anais. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2020.
dc.identifier.urihttp://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1125415-
dc.descriptionO uso do amendoim forrageiro (Arachis pintoi) em pastagens consorciadas com gramíneas tem importância econômica e ambiental. Avanços no programa de melhoramento da espécie podem ser obtidos com a ampla informação gerada pelo sequenciamento de segunda geração. A tecnologia de RNA-Seq permite obter extensa cobertura dos genes existentes no genoma com custo consideravelmente baixo. Os dados gerados possibilitam identificar novos marcadores, validar genes e rotas metabólicas. Atualmente existem poucos microssatélites disponíveis para o amendoim forrageiro. Assim, o objetivo deste trabalho foi desenvolver novos marcadores microssatélites a partir de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro. O RNA de duas cultivares (Belomonte e Amarillo MG-100) foi extraído e utilizado para montagem das bibliotecas, as quais foram sequenciadas e tiveram seu genoma funcional montado com o software Trinity® e metodologia de novo. Um total de 336 milhões de reads foi obtido, dos quais 84.229 foram utilizados na identificação de microssatélites. Dos 4.461 marcadores encontrados, 186 foram selecionados para validação e 80 (43%) apresentaram perfil ideal de amplificação. Desses 80, 29 foram genotipados e apresentaram-se polimórficos. Foi possível acessar a diversidade genética em 20 genótipos. Esses dados indicam a informatividade dos novos marcadores, os quais poderão contribuir para acelerar o melhoramento do amendoim forrageiro.
dc.formatBanner.
dc.language.isopor
dc.relation.ispartofseries(Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 2).
dc.rightsopenAccesspt_BR
dc.subjectAmendoim forrageiropt_BR
dc.subjectForage peanutpt_BR
dc.subjectCacahuetes forrajerospt_BR
dc.subjectRNA-Seqpt_BR
dc.subjectRNA sequencingpt_BR
dc.subjectBelomontept_BR
dc.subjectAmarillo MG-100pt_BR
dc.subjectGenoma funcionalpt_BR
dc.subjectCultivo mixtopt_BR
dc.subjectPastos forrajerospt_BR
dc.subjectLeguminosas forrajeraspt_BR
dc.subjectRepeticiones de microsatélitept_BR
dc.subjectAnálisis de secuenciapt_BR
dc.subjectEmbrapa Acrept_BR
dc.subjectRio Branco (AC)pt_BR
dc.subjectAmazonia Occidentalpt_BR
dc.subjectAcrept_BR
dc.subjectAmazônia Ocidentalpt_BR
dc.subjectWestern Amazonpt_BR
dc.titleCaracterização de bibliotecas de RNA-Seq de amendoim forrageiro para o desenvolvimento de novos microssatélites.
dc.typeArtigo em anais e proceedings
dc.subject.thesagroPastagem Consorciada
dc.subject.thesagroLeguminosa Forrageirapt_BR
dc.subject.thesagroGramínea Forrageirapt_BR
dc.subject.thesagroMarcador Genéticopt_BR
dc.subject.thesagroBanco de Germoplasmapt_BR
dc.subject.nalthesaurusMixed croppingpt_BR
dc.subject.nalthesaurusForage grassespt_BR
dc.subject.nalthesaurusForage legumespt_BR
dc.subject.nalthesaurusArachis pintoipt_BR
dc.subject.nalthesaurusMicrosatellite repeatspt_BR
dc.subject.nalthesaurusSequence analysispt_BR
dc.subject.nalthesaurusGermplasm conservationpt_BR
dc.description.notesEditores técnicos: Virgínia de Souza Álvares; Fabiano Marçal Estanislau.
dc.format.extent2p. 83-88.
riaa.ainfo.id1125415
riaa.ainfo.lastupdate2020-10-14 -03:00:00
dc.contributor.institutionJônatas Chagas de Oliveira, Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Recursos Genéticos da Rede Bionorte, Universidade Federal do Acre; André Lucas Domingos da Silva, Programa de Pós-Graduação em Ciência, Inovação e Tecnologia para a Amazônia, Universidade Federal do Acre; Carla Cristina da Silva, Universidade Estadual de Campinas; Anete Pereira de Souza, Universidade Estadual de Campinas; EDUARDO FERNANDES FORMIGHIERI, CNPAE; TATIANA DE CAMPOS, CPAF-AC.
Appears in Collections:Artigo em anais de congresso (CPAF-AC)

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