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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/1129907
Título: | Metodologias para caracterização molecular de bactérias metanotróficas isoladas de solos florestais. |
Autoria: | MARCONDES, L. C. PEPE, K. B. F. SILVA, K. da |
Afiliação: | LETÍCIA CORRÊA MARCONDES, UNIVERSIDADE POSITIVO; KAUANNA BROK FERREIRA PEPE, UNIVERSIDADE CATÓLICA DO PARANÁ; KRISLE DA SILVA, CNPF. |
Ano de publicação: | 2020 |
Referência: | In: EVENTO DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA DA EMBRAPA FLORESTAS, 19., 2020, Colombo. Anais. Colombo: Embrapa Florestas, 2020. p. 17. |
Conteúdo: | Bactérias metanotróficas são capazes de utilizar o metano (CH4) como sua única fonte de carbono e podem ser uma alternativa para a redução deste gás na atmosfera. O objetivo deste trabalho foi estabelecer metodologias para a caracterização molecular de bactérias metanotróficas isoladas de solos florestais. Para a caracterização dessas bactérias, são utilizadas técnicas de extração de DNA, amplificação por PCR e sequenciamento dos genes pmoA e 16S rRNA. O experimento foi realizado com nove bactérias consideradas metanotróficas. Estas tiveram seu DNA total extraído utilizando kit Pure Link genomic DNA (Invitrogen). O PCR foi realizado por meio da amplificação do gene pmoA, utilizando os oligonucleotídeos iniciadores A189F e A682R e a combinação A189FA e o Mb661. O pmoAé um dos genes que codificam a menato monooxigenase, enzima responsável pela oxidação do CH4. Como controle positivo foi incluído DNA extraído de uma amostra de solo oriundo de floresta. Para o gene 16S rRNA, foi utilizado os oligonucleotídeos 27F e 1492R, universal para bactérias. A eficiência da extração de DNA e as amplificações foram checadas em gel de agarose 1%, corados com brometo de etídeo. A extração de DNA foi eficiente com o kit comercial. Quanto às amplificações por PCR do gene pmoA, estas não foram eficientes, resultando em ausência de ou amplificações inespecíficas, tanto para os isolados bacterianos quanto para o controle (DNA total do solo). A amplificação do gene 16S rRNA foi eficiente para todas as bactérias e o produto amplificado será enviado para sequenciamento. Portanto, conclui-se que o protocolo para a amplificação do gene pmoA necessita de ajustes. |
Thesagro: | Metano Floresta Solo Florestal |
Palavras-chave: | 16S rRNA Metano monooxigenase Bactéria metanotrófica |
Série: | (Embrapa Florestas. Documentos, 343). |
Tipo do material: | Resumo em anais e proceedings |
Acesso: | openAccess |
Aparece nas coleções: | Resumo em anais de congresso (CNPF) |
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Doc-343-1904-Evinci-2020-final-19.pdf | 224,1 kB | Adobe PDF | Visualizar/Abrir |