Title:	Anotação funcional, classificação e expressão diferencial de fitoalexinas em cultivares de Vitis spp. inoculadas com Xanthomonas citri.
Authors:	PEREIRA, M. P. M.
Affiliation:	MARIA POLIANA MARTINS PEREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO VALE DO SÃO FRANCISCO.
Date Issued:	2023
Citation:	2023.
Pages:	57 f.
Description:	A região do Vale do São Francisco destaca-se como o maior polo nacional produtor de fruticultura irrigada, tendo como um dos destaques, o cultivo da videira. No entanto, o cancro bacteriano da videira causado pela bactéria X. citri pv. Viti cola (Xcv), tem afetado a produtividade e a qualidade da cultura. Assim, o objetivo deste trabalho foi identificar, caracterizar e analisar as fitoalexinas envolvidas no processo de defesa em videira infectada por X. citri para avaliação de seu potencial para o melhoramento genético ou biotecnologia da espécie. O experimento foi conduzido em casa de vegetação visando a geração de bibliotecas de RNA-Seq a partir de clones de videira da cultivar Red Globe (susceptível a Xcv) e do híbrido IAC-572 (moderadamente resistente a Xcv). As plantas foram inoculadas com uma suspensão bacteriana e tiveram seus tecidos foliares coletados após 90 minutos de inoculação com a bactéria. O RNA total foi extraído, purificado e enviado para a construção das bibliotecas de RNA-Seq e sequenciado. Foi realizada a identificação das sequências candidatas das famílias gênicas Estilbenes Sintases (STS) e Resveratrol O-metiltransferases (ROMT) e calculados o peso molecular (pM) e o ponto isoelétrico (pI), e realizada a localização subcelular. Os motivos conservados foram identificados pelo MEME-Suit e as localizações cromossômicas foram extraídas do Phytozome v13 e NCBI. Foi realizada a localização dos genes e identificação das estruturas gênicas de STS e ROMT. As proteínas caracterizadas foram submetidas a um alinhamento múltiplo pelo ClustalW e as árvores genéticas foram construídas no MEGA X. A maioria das sequências STS e ROMT apresentaram características ácidas, pM variável e localização subcelular predominante no citoplasma. Os dados de Ontologia Gênica das proteínas STS das duas espécies de videira apresentaram Processo Biológico (PB) relacionado aos processos biossintéticos, metabólicos, respostas a estímulos, resposta a estresses e defesa vegetal. A Função Molecular indicou a participação das proteínas em atividades de triidroxiestilbene sintase, transferase, acetiltransferase e catalítica. O fenograma demonstrou a formação de sete clusters para a família STS e três para ROMT. O heatmap gerado para os transcritos STS demonstrou a formação de dois clusters, sendo um para cada cultivar de videira estudada. Os dados de expressão in silico indicaram que o cluster do híbrido IAC-572 reuniu três transcritos STS reprimidos e um induzido, enquanto o cluster da cultivar Red Globe reuniu um transcrito induzido. Para ROMT foi observado a formação de dois clusters, sendo um para cada cultivar. No cluster do híbrido IAC-572 nenhum transcrito foi induzido e no cluster da Red Globe foram verificados dois transcritos induzidos. A inoculação com X. citri após 90 minutos de estresse resultam na indução de poucos transcritos das famílias de genes STS e ROMT no híbrido IAC-572, no entanto, fica evidente que as cultivares apresentam estratégias de defesa contrastantes frente ao estresse ocasionado pelo agente bacteriano.
Thesagro:	Uva Xanthomonas Citri Cancro Bacteriano Defesa Vegetal
NAL Thesaurus:	Resveratrol Bacterial canker Grapes Plant diseases and disorders
Keywords:	RNA-Seq Estilbene sintase Resveratrol O-metiltransfesase
Notes:	Dissertação (Mestrado em Produção Vegetal) - Universidade Federal do Vale do São Francisco, Petrolina. Orientada por Natoniel Franklin de Melo, Embrapa Semiárido.
Type of Material:	Teses
Access:	openAccess
Appears in Collections:	Tese/dissertação (CPATSA)