Title:	Montagem inicial do genoma de amendoim forrageiro.
Authors:	OLIVEIRA, J. C. de ASSIS, G. M. L. de CAMPOS, T. de PESSOA FILHO, M. A. C. de P.
Affiliation:	JÔNATAS CHAGAS DE OLIVEIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO ACRE; GISELLE MARIANO LESSA DE ASSIS, CNPGC; TATIANA DE CAMPOS, CPAC; MARCO AURÉLIO CALDAS DE PINHO PESSOA FILHO, CENARGEN.
Date Issued:	2025
Citation:	In: SEMINÁRIO DA EMBRAPA ACRE DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA E PÓS-GRADUAÇÃO, 7., 2024, Rio Branco, AC. Pesquisa e bioeconomia no Acre: anais [...]. Rio Branco, AC: Embrapa Acre, 2025. p. 71. (Embrapa Acre. Eventos técnicos & científicos, 7).
Description:	O amendoim forrageiro (Arachis pintoi Krapov. e W.C. Greg.) tornou-se conhecido por suas vantagens como cultura de cobertura verde, que incluem proteção contra erosão, aumento da retenção de umidade do solo e fixação biológica de nitrogênio. Seu uso em pastagens consorciadas com gramíneas tem contribuído para o ganho de peso e redução de até 7 meses no tempo de abate do gado. No entanto, a quantidade limitada de ferramentas moleculares para auxiliar no desenvolvimento de novas cultivares tem sido apontada como um gargalo significativo dentro do programa de melhoramento. Assim, o objetivo deste estudo foi a obtenção do rascunho do genoma de A. pintoi. O sequenciamento foi realizado com os equipamentos PacBio Sequel II e Revio. A montagem inicial foi construída com o programa Hifiasm. Posteriormente, os programas Blobtools e MitoHiFi foram empregados para detectar e eliminar sequências de contaminantes e organelas. A montagem final resultou em 428 fragmentos, com tamanho total de 1,5 Gpb. O valor de N50 foi 31,6 Mpb e o maior fragmento teve 106,8 Mpb. A análise de completude da montagem, utilizando o banco de dados embryophyta_odb10, mostrou 99,00% de genes ortólogos completos, com apenas 0,60% fragmentado e 0,40% ausente. A anotação de regiões repetitivas indicou que 78,25% do genoma consistia em repetições. Essa é a primeira montagem de genoma na secção Caulorhizae do gênero Arachis, o que contribuirá grandemente ao entendimento da diversidade genética e filogenia dentro do gênero, além de permitir o desenvolvimento e aplicação de tecnologias de genotipagem de última geração que darão suporte ao programa de melhoramento.
Thesagro:	Genoma Amendoim Leguminosa Forrageira
NAL Thesaurus:	Arachis pintoi
Type of Material:	Resumo em anais e proceedings
Access:	openAccess
Appears in Collections:	Resumo em anais de congresso (CNPGC)