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http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/596763
Title: | Predição do valor genético total de touros da raça Holandesa por meio de mapas densos de marcadores. |
Authors: | SILVA, M. V. G. B.![]() ![]() TASSELL, C. P. V. ![]() ![]() SONSTEGARD, T. S. ![]() ![]() MATUKUMALLI, L. ![]() ![]() SCHROEDER, S. ![]() ![]() VANRADEN, P. ![]() ![]() WIGGANS, G. ![]() ![]() |
Affiliation: | Marcos Vinicius Gualberto Barbosa da Silva Embrapa Gado de Leite / USDA USA; Curtis Van Tassell USDA USA; Tad S. Sonstegard USDA USA; Lakshmi Matukumalli George Mason University USA; Steven Schroeder USDA USA; Paul VanRaden USDA USA; George Wiggans USDA USA. |
Date Issued: | 2008 |
Citation: | In: REUNIÃO ANUAL DA SOCIEDADE BRASILEIRA DE ZOOTECNIA. 45., 2008, Lavras, MG. Anais... Viçosa, MG: Sociedade Brasileira de Zootecnia, 2008. |
Description: | A seleção genômica é a forma de seleção assistida em que os marcadores genéticos distribuídos ao longo de todo o genoma são usados na avaliação genética, esperando-se que os quantitative trait loci (QTL) estejam em desequilíbrio de ligação com pelo menos um marcador. O uso da seleção genômica tornou-se possível graças ao grande número de SNPs descorbertos durante o seqüenciamento do genoma bovino e aos novos métodos de genotipagem de SNPs em larga escala, como o novo Illumina iSelect Bovine 50K Chip. Na seleção genômica, a escolha dos indivíduos é baseada na soma das estimativas dos efeitos de todos os marcadores ao longo do genoma, ajustados como efeitos aleatórios. O objetivo desse trabalho foi usar a ridge regression para predizer o valor genético genômico de 474 touros jovens holandeses nascidos após 2000, a partir de grande número de marcadores simples em todo o genoma. Para tanto, foram usados os valores genéticos de 2.378 touros da raça Holandesa nascidos antes de 2000, publicados em Agosto/2003. Os efeitos dos marcadores foram estimados por ridge regression (solução BLUP) por meio de programas escritos nas linguagens Fortran e R environment. Pode-se concluir que a ridge regression não é metodologia mais adequada para estimação dos valores genômicos e que, provavelmente, métodos bayesianos que assumam distribuição a priori das variâncias associadas com os segmentos cromossômicos possam fornecer estimativas mais confiáveis dos valores genômicos. |
Thesagro: | Marcador Genético |
Keywords: | Bovinos Seleção genômica SNP |
Type of Material: | Artigo em anais e proceedings |
Access: | openAccess |
Appears in Collections: | Artigo em anais de congresso (CNPGL)![]() ![]() |
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Predicao-do-valor-genetico-total-de-touros-da-raca-Holandesa.pdf | 127.65 kB | Adobe PDF | ![]() View/Open |