Um software para extração de ESTs, CONTIGS e SINGLETS do CAFEST.

GUERRA, R. L.; ALVARENGA, S. M.; CAIXETA, E. T.; GOULART, C. de C.

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DC Field	Value	Language
dc.contributor.author	GUERRA, R. L.	pt_BR
dc.contributor.author	ALVARENGA, S. M.	pt_BR
dc.contributor.author	CAIXETA, E. T.	pt_BR
dc.contributor.author	GOULART, C. de C.	pt_BR
dc.date.accessioned	2011-10-27T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.accessioned	2011-10-27T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.available	2011-10-27T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.available	2011-10-27T11:11:11Z	pt_BR
dc.date.created	2011-10-27	pt_BR
dc.date.issued	2011	pt_BR
dc.identifier.citation	In: SIMPÓSIO DE PESQUISA DOS CAFÉS DO BRASIL, 7., 2011, Araxá. Anais... Brasília, DF: Embrapa Café, 2011.	pt_BR
dc.identifier.uri	http://www.alice.cnptia.embrapa.br/alice/handle/doc/904264	pt_BR
dc.description	Uma das dificuldades encontrada atualmente para os usuários da base de dados do Projeto Brasileiro do Genoma Café (CafEST) é a dificuldade em extrair manualmente todas as sequências armazenadas em seus projetos, no sistema Gene Projects. A partir dessa necessidade, foi desenvolvido um software para fazer a automatização do processo. Desta forma, o usuário do CafEST passa a dispor da comodidade de apenas informar ao programa quais projetos ele deseja que tenham as ESTs, contigs ou singlets extraídos. O programa consiste em dois scripts, um para fazer a extração das ESTs e outro para fazer a extração dos contigs e dos singlets. Os dois scripts retiram do CafEST apenas as ESTs, os contigs e singlets e salvam cada um desses em um arquivo do tipo FASTA. Isto facilita o uso dos mesmos em outras bases de dados e/ou ferramentas de bioinformática	pt_BR
dc.language.iso	por	pt_BR
dc.rights	openAccess	pt_BR
dc.subject	Programação Script	pt_BR
dc.subject	Genoma café	pt_BR
dc.subject	ESTs	pt_BR
dc.title	Um software para extração de ESTs, CONTIGS e SINGLETS do CAFEST.	pt_BR
dc.type	Artigo em anais e proceedings	pt_BR
dc.date.updated	2014-10-07T11:11:11Z	pt_BR
riaa.ainfo.id	904264	pt_BR
riaa.ainfo.lastupdate	2014-10-07	pt_BR
dc.contributor.institution	RAFAEL LUCIANO GUERRA, UFV; SAMUEL MAZZINGHY ALVARENGA, UFV; EVELINE TEIXEIRA CAIXETA, SAPC; CARLOS DE CASTRO GOULART, UFV.	pt_BR
Appears in Collections:	Artigo em anais de congresso (SAPC)

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