Título:	Identificação de marcadores moleculares associados à qualidade da pelagem no gado Canchim.
Autor:	NICOLA, A. C. MARCONDES, C. R. GIGLIOTI, R. MACHADO, T. S. IBELLI, A. M. G.
Afiliación:	AMANDA CAROLINE NICOLA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE SÃO CARLOS; CINTIA RIGHETTI MARCONDES, CPPSE; RODRIGO GIGLIOTI, INSTITUTO DE ZOOTECNIA; TAÍS SEVERINO MACHADO, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AGRESTE DE PERNAMBUCO; ADRIANA MERCIA GUARATINI IBELLI, CPPSE.
Año:	2025
Referencia:	In: JORNADA CIENTÍFICA EMBRAPA DE SÃO CARLOS, 17., 2025, São Carlos, SP. Anais... São Carlos, SP: 2025. p. 15.
Descripción:	A qualidade da pelagem é uma característica essencial que confere melhor adaptabilidade dos bovinos ao clima tropical, refletindo positivamente nas suas características de produção. No entanto, não há informações quanto aos genes e mecanismos moleculares envolvidos com este fenótipo na raça Canchim (5/8 Charolês e 3/8 Zebu). Portanto, este trabalho teve como objetivo identificar polimorfismos de uma única base (SNPs) associados à qualidade da pelagem na raça Canchim por meio de um estudo de análise de associação global do genoma (GWAS). Para isso, foram utilizadas informações de 709 animais da Embrapa Pecuária Sudeste que apresentavam avaliação de escore de pelagem (1 a 6) à desmama e haviam sido previamente genotipados com os chips GGP Bovine 50K GGP, 100K ou uHD (Neogen). Foram obtidos os SNPs compartilhados entre os diferentes chips (36068) e então realizado controle de qualidade (QC) das amostras e SNPs no programa PLINK 1.9, removendo animais com call rate <0,9 e SNPs com call rate <0,98, heterozigosidade >3,0 desviospadrão e SNPs com frequência do alelo menor (MAF) <1% e os que falharam no teste de equilíbrio de Hardy-Weinberg (HWE) <1x10-6. A análise de associação foi realizada no software GEMMA2 que utiliza modelos lineares mistos. Os limiares de significância seguiram os critérios de Bonferroni para significativo (0,05/número de SNPs independentes) e sugestivo (1/número de SNPs independentes). As análises funcionais foram realizadas no VEP do Ensembl v. 114. Após o QC, 33804 SNPs e 682 animais foram mantidos para a análise de GWAS. Foram encontrados dois SNPs, um no BTA13 (rs109983818) e um no BTA19 (rs41639053) sugestivamente associados à qualidade da pelagem na raça Canchim. O rs109983818 está localizado em um íntron de um lncRNA, enquanto o rs41639053 está em uma região intergênica próxima a 11 genes, incluindo o BTBD17, que já foi associado a desordens como hipotricose e anidrose em humanos. Além deste, estes SNPs estão em regiões de genes já associados a resistência a parasitas (SNPA25), adaptabilidade (MRPL33) e estresse térmico (KIF19) em diferentes espécies. Portanto, neste trabalho foi possível identificar novos SNPs associados sugestivamente à qualidade do pelame, podendo também conferir adaptabilidade em bovinos da raça Canchim.
Thesagro:	Marcador Molecular Pelo Gado Canchim
Palabras clave:	Pelagem
Citación:	(Embrapa Pecuária Sudeste. Eventos Técnicos & Científicos, 4)
ISSN:	2966-0289
Notas:	Financiamento: FAPESP e CNPq | PIBIC/PIBIT (163441/2024-3)
Tipo de Material:	Resumo em anais e proceedings
Acceso:	openAccess
Aparece en las colecciones:	Resumo em anais de congresso (CPPSE)