Title:	Análise dos coeficientes de endogamia e de parentesco para qualquer nível de ploidia usando o pacote estatístico R.
Authors:	PETERNELLI, L. A. FERREIRA, F. M. ROCHA, R. B. BARROS, W. S. BARBOSA, W. H. P.
Affiliation:	LUIZ ALEXANDRE PETERNELLI, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA; FÁBIO MEDEIROS FERREIRA, UNIVERSIDADE FEDERAL DO AMAZONAS; RODRIGO BARROS ROCHA, CPAF-RO; WILLIAN SILVA BARROS, UNIVERSIDADE FEDERAL DE PELOTAS; MÁRCIO HENRIQUE PEREIRA BARBOSA, UNIVERSIDADE FEDERAL DE VIÇOSA.
Date Issued:	2009
Citation:	Bragantia, Campinas, v. 68, n. 4, p. 849-855, 2009.
Description:	São poucos os softwares disponíveis para a análise de parentesco e, até a presente data, nenhum pode realizar a análise de parentesco para organismos poliplóides, com número par (2k) de cromossomos. Implementou-se junto ao programa R uma rotina capaz de executar a análise de parentesco para qualquer nível 2k de ploidia, número de indivíduos (ou populações) e número de gerações envolvidas na árvore genealógica. A função principal, calc.rxy() calcula o coeficiente de endogamia (F X) de cada indivíduo; coeficientes de parentesco (rXY) entre dois indivíduos quaisquer; e coeficiente de parentesco médio, variância, mínimo e máximo, para cada indivíduo. Ela pode mostrar a matriz completa de parentesco ou uma submatriz pré-definida de indivíduos selecionados. Adicionalmente, foram incluidas funções que servem para identificar erros de redundância dos dados originais (checar.nomes()) e para identificar os pares de indivíduos com rXY superior a certo limite especificado pelo pesquisador (corte.rxy()). Essas funções podem ser usadas na análise de pedigrees com um número elevado de indivíduos e poderão ser utilizadas pela comunidade científica livremente, sem restrições à plataforma operacional utilizada. Destaca-se a vantagem em se poder trabalhar com qualquer nível 2k de ploidia, mesmo quando existe a possibilidade de certo indivíduo ser oriundo de autofecundação, aspecto comum em várias espécies vegetais.
Thesagro:	Endogamia
Type of Material:	Artigo de periódico
Access:	openAccess
Appears in Collections:	Artigo em periódico indexado (CPAF-RO)